Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Lamc3Q9R0B6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
Lamc3Q9R0B6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Lamc3Q9R0B6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Lamc3Q9R0B6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Lamc3Q9R0B6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Lamc3Q9R0B6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Lamc3Q9R0B6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Lamc3Q9R0B6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Lamc3Q9R0B6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Lamc3Q9R0B6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Lamc3Q9R0B6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Lamc3Q9R0B6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Lamc3Q9R0B6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Lamc3Q9R0B6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
Lamc3Q9R0B6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Lamc3Q9R0B6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Lamc3Q9R0B6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Lamc3Q9R0B6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
Lamc3Q9R0B6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Lamc3Q9R0B6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Lamc3Q9R0B6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Lamc3Q9R0B6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Lamc3Q9R0B6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Lamc3Q9R0B6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Lamc3Q9R0B6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Lamc3Q9R0B6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Lamc3Q9R0B6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Lamc3Q9R0B6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Lamc3Q9R0B6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Lamc3Q9R0B6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Lamc3Q9R0B6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Lamc3Q9R0B6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Lamc3Q9R0B6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Lamc3Q9R0B6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Lamc3Q9R0B6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Lamc3Q9R0B6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Lamc3Q9R0B6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Lamc3Q9R0B6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Lamc3Q9R0B6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Lamc3Q9R0B6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Lamc3Q9R0B6 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Lamc3Q9R0B6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Lamc3Q9R0B6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Lamc3Q9R0B6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Lamc3Q9R0B6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
Lamc3Q9R0B6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Lamc3Q9R0B6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Lamc3Q9R0B6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Lamc3Q9R0B6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Lamc3Q9R0B6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Lamc3Q9R0B6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Lamc3Q9R0B6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Lamc3Q9R0B6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Lamc3Q9R0B6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Lamc3Q9R0B6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
Lamc3Q9R0B6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Lamc3Q9R0B6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Lamc3Q9R0B6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Lamc3Q9R0B6 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Lamc3Q9R0B6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Lamc3Q9R0B6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Lamc3Q9R0B6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Lamc3Q9R0B6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Lamc3Q9R0B6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Lamc3Q9R0B6 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
Lamc3Q9R0B6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Lamc3Q9R0B6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Lamc3Q9R0B6 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Lamc3Q9R0B6 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
Lamc3Q9R0B6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Lamc3Q9R0B6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Lamc3Q9R0B6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Lamc3Q9R0B6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Lamc3Q9R0B6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Lamc3Q9R0B6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Lamc3Q9R0B6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Lamc3Q9R0B6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Lamc3Q9R0B6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Lamc3Q9R0B6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Lamc3Q9R0B6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Lamc3Q9R0B6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Lamc3Q9R0B6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Lamc3Q9R0B6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Lamc3Q9R0B6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Lamc3Q9R0B6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Lamc3Q9R0B6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Lamc3Q9R0B6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Lamc3Q9R0B6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
Lamc3Q9R0B6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Lamc3Q9R0B6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Lamc3Q9R0B6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Lamc3Q9R0B6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Lamc3Q9R0B6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Lamc3Q9R0B6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
Lamc3Q9R0B6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Lamc3Q9R0B6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Lamc3Q9R0B6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Lamc3Q9R0B6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Lamc3Q9R0B6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms