Protein–RNA interactions for Protein: Q9R078

Prkab1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab1Q9R078 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prkab1Q9R078 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prkab1Q9R078 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Prkab1Q9R078 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prkab1Q9R078 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prkab1Q9R078 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prkab1Q9R078 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prkab1Q9R078 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prkab1Q9R078 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prkab1Q9R078 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Prkab1Q9R078 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prkab1Q9R078 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prkab1Q9R078 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prkab1Q9R078 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Prkab1Q9R078 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prkab1Q9R078 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prkab1Q9R078 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prkab1Q9R078 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prkab1Q9R078 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prkab1Q9R078 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prkab1Q9R078 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prkab1Q9R078 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Prkab1Q9R078 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Prkab1Q9R078 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prkab1Q9R078 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prkab1Q9R078 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prkab1Q9R078 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prkab1Q9R078 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prkab1Q9R078 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prkab1Q9R078 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prkab1Q9R078 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prkab1Q9R078 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prkab1Q9R078 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Prkab1Q9R078 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Prkab1Q9R078 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prkab1Q9R078 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prkab1Q9R078 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prkab1Q9R078 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Prkab1Q9R078 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prkab1Q9R078 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prkab1Q9R078 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prkab1Q9R078 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prkab1Q9R078 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prkab1Q9R078 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prkab1Q9R078 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prkab1Q9R078 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prkab1Q9R078 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prkab1Q9R078 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prkab1Q9R078 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prkab1Q9R078 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prkab1Q9R078 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prkab1Q9R078 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prkab1Q9R078 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prkab1Q9R078 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prkab1Q9R078 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prkab1Q9R078 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prkab1Q9R078 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prkab1Q9R078 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prkab1Q9R078 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prkab1Q9R078 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prkab1Q9R078 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prkab1Q9R078 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prkab1Q9R078 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prkab1Q9R078 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prkab1Q9R078 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prkab1Q9R078 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prkab1Q9R078 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prkab1Q9R078 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prkab1Q9R078 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prkab1Q9R078 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prkab1Q9R078 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prkab1Q9R078 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prkab1Q9R078 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Prkab1Q9R078 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prkab1Q9R078 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prkab1Q9R078 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prkab1Q9R078 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prkab1Q9R078 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prkab1Q9R078 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prkab1Q9R078 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prkab1Q9R078 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prkab1Q9R078 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Prkab1Q9R078 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prkab1Q9R078 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prkab1Q9R078 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prkab1Q9R078 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prkab1Q9R078 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prkab1Q9R078 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prkab1Q9R078 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prkab1Q9R078 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prkab1Q9R078 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prkab1Q9R078 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prkab1Q9R078 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prkab1Q9R078 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prkab1Q9R078 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prkab1Q9R078 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prkab1Q9R078 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prkab1Q9R078 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prkab1Q9R078 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prkab1Q9R078 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms