Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
AmfrQ9R049 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
AmfrQ9R049 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
AmfrQ9R049 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AmfrQ9R049 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AmfrQ9R049 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
AmfrQ9R049 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AmfrQ9R049 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AmfrQ9R049 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AmfrQ9R049 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AmfrQ9R049 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AmfrQ9R049 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AmfrQ9R049 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AmfrQ9R049 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AmfrQ9R049 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AmfrQ9R049 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AmfrQ9R049 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AmfrQ9R049 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AmfrQ9R049 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AmfrQ9R049 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AmfrQ9R049 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
AmfrQ9R049 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AmfrQ9R049 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AmfrQ9R049 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AmfrQ9R049 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AmfrQ9R049 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AmfrQ9R049 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AmfrQ9R049 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AmfrQ9R049 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AmfrQ9R049 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AmfrQ9R049 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AmfrQ9R049 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
AmfrQ9R049 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AmfrQ9R049 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AmfrQ9R049 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AmfrQ9R049 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AmfrQ9R049 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AmfrQ9R049 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AmfrQ9R049 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AmfrQ9R049 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AmfrQ9R049 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
AmfrQ9R049 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
AmfrQ9R049 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AmfrQ9R049 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AmfrQ9R049 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AmfrQ9R049 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AmfrQ9R049 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AmfrQ9R049 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AmfrQ9R049 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AmfrQ9R049 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AmfrQ9R049 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AmfrQ9R049 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AmfrQ9R049 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
AmfrQ9R049 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AmfrQ9R049 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AmfrQ9R049 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AmfrQ9R049 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AmfrQ9R049 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AmfrQ9R049 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AmfrQ9R049 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AmfrQ9R049 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AmfrQ9R049 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AmfrQ9R049 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AmfrQ9R049 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AmfrQ9R049 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AmfrQ9R049 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AmfrQ9R049 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AmfrQ9R049 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AmfrQ9R049 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AmfrQ9R049 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AmfrQ9R049 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AmfrQ9R049 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AmfrQ9R049 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AmfrQ9R049 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AmfrQ9R049 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
AmfrQ9R049 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AmfrQ9R049 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
AmfrQ9R049 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AmfrQ9R049 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
AmfrQ9R049 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AmfrQ9R049 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AmfrQ9R049 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AmfrQ9R049 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AmfrQ9R049 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AmfrQ9R049 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AmfrQ9R049 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AmfrQ9R049 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AmfrQ9R049 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AmfrQ9R049 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
AmfrQ9R049 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
AmfrQ9R049 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AmfrQ9R049 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AmfrQ9R049 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AmfrQ9R049 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AmfrQ9R049 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AmfrQ9R049 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AmfrQ9R049 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AmfrQ9R049 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AmfrQ9R049 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
AmfrQ9R049 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms