Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ11

Exo1, Exonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo1Q9QZ11 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Exo1Q9QZ11 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Exo1Q9QZ11 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Exo1Q9QZ11 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Exo1Q9QZ11 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Exo1Q9QZ11 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Exo1Q9QZ11 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Exo1Q9QZ11 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Exo1Q9QZ11 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Exo1Q9QZ11 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Exo1Q9QZ11 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Exo1Q9QZ11 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Exo1Q9QZ11 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Exo1Q9QZ11 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Exo1Q9QZ11 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Exo1Q9QZ11 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Exo1Q9QZ11 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Exo1Q9QZ11 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Exo1Q9QZ11 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Exo1Q9QZ11 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Exo1Q9QZ11 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Exo1Q9QZ11 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Exo1Q9QZ11 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Exo1Q9QZ11 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Exo1Q9QZ11 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Exo1Q9QZ11 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Exo1Q9QZ11 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Exo1Q9QZ11 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Exo1Q9QZ11 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Exo1Q9QZ11 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Exo1Q9QZ11 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Exo1Q9QZ11 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Exo1Q9QZ11 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Exo1Q9QZ11 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Exo1Q9QZ11 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Exo1Q9QZ11 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Exo1Q9QZ11 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Exo1Q9QZ11 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Exo1Q9QZ11 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Exo1Q9QZ11 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Exo1Q9QZ11 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Exo1Q9QZ11 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Exo1Q9QZ11 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Exo1Q9QZ11 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Exo1Q9QZ11 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Exo1Q9QZ11 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Exo1Q9QZ11 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Exo1Q9QZ11 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Exo1Q9QZ11 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Exo1Q9QZ11 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Exo1Q9QZ11 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Exo1Q9QZ11 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Exo1Q9QZ11 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Exo1Q9QZ11 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Exo1Q9QZ11 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Exo1Q9QZ11 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Exo1Q9QZ11 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Exo1Q9QZ11 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Exo1Q9QZ11 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Exo1Q9QZ11 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Exo1Q9QZ11 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Exo1Q9QZ11 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Exo1Q9QZ11 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Exo1Q9QZ11 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Exo1Q9QZ11 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Exo1Q9QZ11 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Exo1Q9QZ11 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Exo1Q9QZ11 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Exo1Q9QZ11 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Exo1Q9QZ11 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Exo1Q9QZ11 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Exo1Q9QZ11 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Exo1Q9QZ11 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Exo1Q9QZ11 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Exo1Q9QZ11 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Exo1Q9QZ11 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Exo1Q9QZ11 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Exo1Q9QZ11 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Exo1Q9QZ11 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Exo1Q9QZ11 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Exo1Q9QZ11 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Exo1Q9QZ11 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Exo1Q9QZ11 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Exo1Q9QZ11 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Exo1Q9QZ11 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Exo1Q9QZ11 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Exo1Q9QZ11 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Exo1Q9QZ11 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Exo1Q9QZ11 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Exo1Q9QZ11 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Exo1Q9QZ11 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Exo1Q9QZ11 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Exo1Q9QZ11 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Exo1Q9QZ11 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Exo1Q9QZ11 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Exo1Q9QZ11 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Exo1Q9QZ11 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Exo1Q9QZ11 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Exo1Q9QZ11 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Exo1Q9QZ11 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms