Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF9

Ndrg3, Protein NDRG3, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndrg3Q9QYF9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ndrg3Q9QYF9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndrg3Q9QYF9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndrg3Q9QYF9 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndrg3Q9QYF9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms