Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irx4Q9QY61 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Irx4Q9QY61 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irx4Q9QY61 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irx4Q9QY61 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irx4Q9QY61 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irx4Q9QY61 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irx4Q9QY61 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irx4Q9QY61 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irx4Q9QY61 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irx4Q9QY61 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irx4Q9QY61 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irx4Q9QY61 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irx4Q9QY61 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irx4Q9QY61 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irx4Q9QY61 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irx4Q9QY61 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irx4Q9QY61 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irx4Q9QY61 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irx4Q9QY61 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irx4Q9QY61 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irx4Q9QY61 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irx4Q9QY61 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Irx4Q9QY61 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Irx4Q9QY61 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Irx4Q9QY61 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Irx4Q9QY61 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Irx4Q9QY61 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Irx4Q9QY61 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Irx4Q9QY61 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Irx4Q9QY61 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Irx4Q9QY61 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Irx4Q9QY61 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Irx4Q9QY61 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Irx4Q9QY61 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Irx4Q9QY61 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Irx4Q9QY61 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Irx4Q9QY61 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Irx4Q9QY61 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Irx4Q9QY61 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Irx4Q9QY61 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Irx4Q9QY61 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Irx4Q9QY61 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Irx4Q9QY61 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Irx4Q9QY61 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Irx4Q9QY61 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Irx4Q9QY61 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Irx4Q9QY61 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Irx4Q9QY61 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Irx4Q9QY61 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Irx4Q9QY61 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Irx4Q9QY61 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Irx4Q9QY61 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Irx4Q9QY61 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Irx4Q9QY61 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Irx4Q9QY61 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Irx4Q9QY61 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Irx4Q9QY61 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Irx4Q9QY61 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Irx4Q9QY61 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Irx4Q9QY61 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Irx4Q9QY61 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Irx4Q9QY61 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Irx4Q9QY61 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Irx4Q9QY61 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Irx4Q9QY61 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Irx4Q9QY61 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Irx4Q9QY61 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Irx4Q9QY61 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Irx4Q9QY61 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Irx4Q9QY61 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Irx4Q9QY61 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Irx4Q9QY61 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Irx4Q9QY61 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Irx4Q9QY61 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Irx4Q9QY61 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Irx4Q9QY61 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Irx4Q9QY61 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Irx4Q9QY61 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Irx4Q9QY61 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Irx4Q9QY61 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Irx4Q9QY61 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Irx4Q9QY61 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Irx4Q9QY61 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Irx4Q9QY61 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Irx4Q9QY61 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Irx4Q9QY61 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Irx4Q9QY61 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Irx4Q9QY61 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Irx4Q9QY61 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Irx4Q9QY61 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Irx4Q9QY61 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Irx4Q9QY61 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Irx4Q9QY61 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Irx4Q9QY61 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Irx4Q9QY61 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Irx4Q9QY61 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Irx4Q9QY61 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Irx4Q9QY61 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Irx4Q9QY61 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms