Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkp3Q9QY23 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkp3Q9QY23 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkp3Q9QY23 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkp3Q9QY23 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkp3Q9QY23 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkp3Q9QY23 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkp3Q9QY23 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkp3Q9QY23 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkp3Q9QY23 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkp3Q9QY23 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkp3Q9QY23 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkp3Q9QY23 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pkp3Q9QY23 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pkp3Q9QY23 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pkp3Q9QY23 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pkp3Q9QY23 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pkp3Q9QY23 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pkp3Q9QY23 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pkp3Q9QY23 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pkp3Q9QY23 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pkp3Q9QY23 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pkp3Q9QY23 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pkp3Q9QY23 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pkp3Q9QY23 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pkp3Q9QY23 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pkp3Q9QY23 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pkp3Q9QY23 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Pkp3Q9QY23 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pkp3Q9QY23 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pkp3Q9QY23 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pkp3Q9QY23 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Pkp3Q9QY23 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pkp3Q9QY23 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Pkp3Q9QY23 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Pkp3Q9QY23 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pkp3Q9QY23 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pkp3Q9QY23 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pkp3Q9QY23 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pkp3Q9QY23 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pkp3Q9QY23 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pkp3Q9QY23 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pkp3Q9QY23 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pkp3Q9QY23 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pkp3Q9QY23 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pkp3Q9QY23 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pkp3Q9QY23 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pkp3Q9QY23 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pkp3Q9QY23 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pkp3Q9QY23 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pkp3Q9QY23 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pkp3Q9QY23 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pkp3Q9QY23 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pkp3Q9QY23 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pkp3Q9QY23 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pkp3Q9QY23 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pkp3Q9QY23 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pkp3Q9QY23 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pkp3Q9QY23 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pkp3Q9QY23 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pkp3Q9QY23 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pkp3Q9QY23 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pkp3Q9QY23 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pkp3Q9QY23 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pkp3Q9QY23 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pkp3Q9QY23 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pkp3Q9QY23 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pkp3Q9QY23 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pkp3Q9QY23 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pkp3Q9QY23 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pkp3Q9QY23 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pkp3Q9QY23 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pkp3Q9QY23 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pkp3Q9QY23 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Pkp3Q9QY23 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Pkp3Q9QY23 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Pkp3Q9QY23 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Pkp3Q9QY23 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Pkp3Q9QY23 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pkp3Q9QY23 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pkp3Q9QY23 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pkp3Q9QY23 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Pkp3Q9QY23 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pkp3Q9QY23 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pkp3Q9QY23 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pkp3Q9QY23 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pkp3Q9QY23 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pkp3Q9QY23 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pkp3Q9QY23 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pkp3Q9QY23 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pkp3Q9QY23 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pkp3Q9QY23 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pkp3Q9QY23 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pkp3Q9QY23 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pkp3Q9QY23 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pkp3Q9QY23 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Pkp3Q9QY23 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pkp3Q9QY23 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pkp3Q9QY23 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pkp3Q9QY23 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms