Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

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Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Opn4Q9QXZ9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Opn4Q9QXZ9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Opn4Q9QXZ9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Opn4Q9QXZ9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Opn4Q9QXZ9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Opn4Q9QXZ9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Opn4Q9QXZ9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Opn4Q9QXZ9 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Opn4Q9QXZ9 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Opn4Q9QXZ9 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Opn4Q9QXZ9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Opn4Q9QXZ9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Opn4Q9QXZ9 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Opn4Q9QXZ9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Opn4Q9QXZ9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Opn4Q9QXZ9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Opn4Q9QXZ9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Opn4Q9QXZ9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Opn4Q9QXZ9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Opn4Q9QXZ9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Opn4Q9QXZ9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Opn4Q9QXZ9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Opn4Q9QXZ9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Opn4Q9QXZ9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Opn4Q9QXZ9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Opn4Q9QXZ9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Opn4Q9QXZ9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Opn4Q9QXZ9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Opn4Q9QXZ9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Opn4Q9QXZ9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Opn4Q9QXZ9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Opn4Q9QXZ9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Opn4Q9QXZ9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Opn4Q9QXZ9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Opn4Q9QXZ9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Opn4Q9QXZ9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Opn4Q9QXZ9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Opn4Q9QXZ9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Opn4Q9QXZ9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Opn4Q9QXZ9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Opn4Q9QXZ9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Opn4Q9QXZ9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Opn4Q9QXZ9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Opn4Q9QXZ9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Opn4Q9QXZ9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Opn4Q9QXZ9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Opn4Q9QXZ9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Opn4Q9QXZ9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Opn4Q9QXZ9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Opn4Q9QXZ9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Opn4Q9QXZ9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Opn4Q9QXZ9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Opn4Q9QXZ9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Opn4Q9QXZ9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Opn4Q9QXZ9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Opn4Q9QXZ9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Opn4Q9QXZ9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Opn4Q9QXZ9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Opn4Q9QXZ9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Opn4Q9QXZ9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Opn4Q9QXZ9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Opn4Q9QXZ9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Opn4Q9QXZ9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Opn4Q9QXZ9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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