Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX8

Nufip1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nufip1Q9QXX8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nufip1Q9QXX8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nufip1Q9QXX8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nufip1Q9QXX8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nufip1Q9QXX8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nufip1Q9QXX8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nufip1Q9QXX8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nufip1Q9QXX8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nufip1Q9QXX8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nufip1Q9QXX8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nufip1Q9QXX8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nufip1Q9QXX8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nufip1Q9QXX8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nufip1Q9QXX8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Nufip1Q9QXX8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nufip1Q9QXX8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nufip1Q9QXX8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nufip1Q9QXX8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Nufip1Q9QXX8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nufip1Q9QXX8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nufip1Q9QXX8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Nufip1Q9QXX8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nufip1Q9QXX8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nufip1Q9QXX8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nufip1Q9QXX8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nufip1Q9QXX8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nufip1Q9QXX8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nufip1Q9QXX8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nufip1Q9QXX8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nufip1Q9QXX8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nufip1Q9QXX8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nufip1Q9QXX8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nufip1Q9QXX8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nufip1Q9QXX8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nufip1Q9QXX8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nufip1Q9QXX8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nufip1Q9QXX8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nufip1Q9QXX8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nufip1Q9QXX8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nufip1Q9QXX8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nufip1Q9QXX8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nufip1Q9QXX8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nufip1Q9QXX8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Nufip1Q9QXX8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nufip1Q9QXX8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nufip1Q9QXX8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nufip1Q9QXX8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Nufip1Q9QXX8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nufip1Q9QXX8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nufip1Q9QXX8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nufip1Q9QXX8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nufip1Q9QXX8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nufip1Q9QXX8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nufip1Q9QXX8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nufip1Q9QXX8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nufip1Q9QXX8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nufip1Q9QXX8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nufip1Q9QXX8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nufip1Q9QXX8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nufip1Q9QXX8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nufip1Q9QXX8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nufip1Q9QXX8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nufip1Q9QXX8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nufip1Q9QXX8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nufip1Q9QXX8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nufip1Q9QXX8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nufip1Q9QXX8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nufip1Q9QXX8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nufip1Q9QXX8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Nufip1Q9QXX8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nufip1Q9QXX8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nufip1Q9QXX8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nufip1Q9QXX8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nufip1Q9QXX8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nufip1Q9QXX8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nufip1Q9QXX8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nufip1Q9QXX8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nufip1Q9QXX8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nufip1Q9QXX8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nufip1Q9QXX8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nufip1Q9QXX8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nufip1Q9QXX8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nufip1Q9QXX8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nufip1Q9QXX8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nufip1Q9QXX8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nufip1Q9QXX8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nufip1Q9QXX8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nufip1Q9QXX8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nufip1Q9QXX8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nufip1Q9QXX8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nufip1Q9QXX8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nufip1Q9QXX8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nufip1Q9QXX8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Nufip1Q9QXX8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nufip1Q9QXX8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nufip1Q9QXX8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nufip1Q9QXX8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nufip1Q9QXX8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nufip1Q9QXX8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nufip1Q9QXX8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms