Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cbx8Q9QXV1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cbx8Q9QXV1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cbx8Q9QXV1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cbx8Q9QXV1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cbx8Q9QXV1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cbx8Q9QXV1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cbx8Q9QXV1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cbx8Q9QXV1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cbx8Q9QXV1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cbx8Q9QXV1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cbx8Q9QXV1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cbx8Q9QXV1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cbx8Q9QXV1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cbx8Q9QXV1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cbx8Q9QXV1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cbx8Q9QXV1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cbx8Q9QXV1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cbx8Q9QXV1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cbx8Q9QXV1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Cbx8Q9QXV1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cbx8Q9QXV1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cbx8Q9QXV1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cbx8Q9QXV1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cbx8Q9QXV1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cbx8Q9QXV1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cbx8Q9QXV1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cbx8Q9QXV1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cbx8Q9QXV1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cbx8Q9QXV1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cbx8Q9QXV1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cbx8Q9QXV1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cbx8Q9QXV1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cbx8Q9QXV1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cbx8Q9QXV1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cbx8Q9QXV1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cbx8Q9QXV1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cbx8Q9QXV1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Cbx8Q9QXV1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cbx8Q9QXV1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cbx8Q9QXV1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cbx8Q9QXV1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cbx8Q9QXV1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cbx8Q9QXV1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Cbx8Q9QXV1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cbx8Q9QXV1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cbx8Q9QXV1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cbx8Q9QXV1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cbx8Q9QXV1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cbx8Q9QXV1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cbx8Q9QXV1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cbx8Q9QXV1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cbx8Q9QXV1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cbx8Q9QXV1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cbx8Q9QXV1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cbx8Q9QXV1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Cbx8Q9QXV1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Cbx8Q9QXV1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cbx8Q9QXV1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cbx8Q9QXV1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Cbx8Q9QXV1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Cbx8Q9QXV1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cbx8Q9QXV1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cbx8Q9QXV1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cbx8Q9QXV1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cbx8Q9QXV1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cbx8Q9QXV1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cbx8Q9QXV1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cbx8Q9QXV1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cbx8Q9QXV1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cbx8Q9QXV1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cbx8Q9QXV1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cbx8Q9QXV1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cbx8Q9QXV1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cbx8Q9QXV1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cbx8Q9QXV1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cbx8Q9QXV1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cbx8Q9QXV1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cbx8Q9QXV1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cbx8Q9QXV1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cbx8Q9QXV1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cbx8Q9QXV1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cbx8Q9QXV1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cbx8Q9QXV1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cbx8Q9QXV1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cbx8Q9QXV1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cbx8Q9QXV1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cbx8Q9QXV1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cbx8Q9QXV1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cbx8Q9QXV1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cbx8Q9QXV1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cbx8Q9QXV1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cbx8Q9QXV1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cbx8Q9QXV1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cbx8Q9QXV1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cbx8Q9QXV1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cbx8Q9QXV1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cbx8Q9QXV1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cbx8Q9QXV1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cbx8Q9QXV1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms