Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWL7

Krt17, Keratin, type I cytoskeletal 17, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt17Q9QWL7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt17Q9QWL7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt17Q9QWL7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt17Q9QWL7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt17Q9QWL7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt17Q9QWL7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt17Q9QWL7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt17Q9QWL7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt17Q9QWL7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt17Q9QWL7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt17Q9QWL7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt17Q9QWL7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt17Q9QWL7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt17Q9QWL7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt17Q9QWL7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt17Q9QWL7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt17Q9QWL7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt17Q9QWL7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt17Q9QWL7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt17Q9QWL7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt17Q9QWL7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt17Q9QWL7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt17Q9QWL7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt17Q9QWL7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt17Q9QWL7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt17Q9QWL7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt17Q9QWL7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt17Q9QWL7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt17Q9QWL7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt17Q9QWL7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt17Q9QWL7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt17Q9QWL7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt17Q9QWL7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt17Q9QWL7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt17Q9QWL7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt17Q9QWL7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt17Q9QWL7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt17Q9QWL7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt17Q9QWL7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt17Q9QWL7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt17Q9QWL7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt17Q9QWL7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt17Q9QWL7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt17Q9QWL7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Krt17Q9QWL7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Krt17Q9QWL7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Krt17Q9QWL7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt17Q9QWL7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt17Q9QWL7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Krt17Q9QWL7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt17Q9QWL7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
Krt17Q9QWL7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt17Q9QWL7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt17Q9QWL7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt17Q9QWL7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt17Q9QWL7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt17Q9QWL7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Krt17Q9QWL7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Krt17Q9QWL7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt17Q9QWL7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt17Q9QWL7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt17Q9QWL7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt17Q9QWL7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt17Q9QWL7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt17Q9QWL7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt17Q9QWL7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt17Q9QWL7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt17Q9QWL7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.31■■□□□ 1
Krt17Q9QWL7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt17Q9QWL7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Krt17Q9QWL7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt17Q9QWL7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt17Q9QWL7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt17Q9QWL7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt17Q9QWL7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Krt17Q9QWL7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Krt17Q9QWL7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt17Q9QWL7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt17Q9QWL7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Krt17Q9QWL7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt17Q9QWL7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt17Q9QWL7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt17Q9QWL7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt17Q9QWL7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Krt17Q9QWL7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Krt17Q9QWL7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt17Q9QWL7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt17Q9QWL7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Krt17Q9QWL7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt17Q9QWL7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Krt17Q9QWL7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Krt17Q9QWL7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt17Q9QWL7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt17Q9QWL7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt17Q9QWL7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Krt17Q9QWL7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Krt17Q9QWL7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt17Q9QWL7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Krt17Q9QWL7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt17Q9QWL7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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