Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PdcQ9QW08 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PdcQ9QW08 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PdcQ9QW08 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PdcQ9QW08 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PdcQ9QW08 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PdcQ9QW08 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PdcQ9QW08 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PdcQ9QW08 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PdcQ9QW08 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PdcQ9QW08 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PdcQ9QW08 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PdcQ9QW08 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PdcQ9QW08 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PdcQ9QW08 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PdcQ9QW08 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PdcQ9QW08 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PdcQ9QW08 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PdcQ9QW08 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PdcQ9QW08 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PdcQ9QW08 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PdcQ9QW08 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PdcQ9QW08 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PdcQ9QW08 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PdcQ9QW08 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PdcQ9QW08 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PdcQ9QW08 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PdcQ9QW08 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PdcQ9QW08 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PdcQ9QW08 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PdcQ9QW08 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PdcQ9QW08 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PdcQ9QW08 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PdcQ9QW08 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PdcQ9QW08 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PdcQ9QW08 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PdcQ9QW08 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PdcQ9QW08 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PdcQ9QW08 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PdcQ9QW08 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PdcQ9QW08 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PdcQ9QW08 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PdcQ9QW08 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PdcQ9QW08 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PdcQ9QW08 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PdcQ9QW08 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PdcQ9QW08 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PdcQ9QW08 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PdcQ9QW08 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PdcQ9QW08 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PdcQ9QW08 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PdcQ9QW08 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PdcQ9QW08 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PdcQ9QW08 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PdcQ9QW08 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PdcQ9QW08 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PdcQ9QW08 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PdcQ9QW08 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PdcQ9QW08 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PdcQ9QW08 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PdcQ9QW08 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PdcQ9QW08 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PdcQ9QW08 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PdcQ9QW08 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PdcQ9QW08 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PdcQ9QW08 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PdcQ9QW08 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PdcQ9QW08 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PdcQ9QW08 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PdcQ9QW08 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PdcQ9QW08 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PdcQ9QW08 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PdcQ9QW08 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PdcQ9QW08 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PdcQ9QW08 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PdcQ9QW08 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PdcQ9QW08 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PdcQ9QW08 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PdcQ9QW08 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PdcQ9QW08 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PdcQ9QW08 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PdcQ9QW08 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PdcQ9QW08 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PdcQ9QW08 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PdcQ9QW08 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PdcQ9QW08 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PdcQ9QW08 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PdcQ9QW08 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PdcQ9QW08 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PdcQ9QW08 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PdcQ9QW08 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PdcQ9QW08 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PdcQ9QW08 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PdcQ9QW08 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PdcQ9QW08 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PdcQ9QW08 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PdcQ9QW08 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PdcQ9QW08 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PdcQ9QW08 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PdcQ9QW08 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms