Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVN7

Tcea2, Transcription elongation factor A protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea2Q9QVN7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tcea2Q9QVN7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tcea2Q9QVN7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tcea2Q9QVN7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tcea2Q9QVN7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tcea2Q9QVN7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tcea2Q9QVN7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tcea2Q9QVN7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tcea2Q9QVN7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tcea2Q9QVN7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tcea2Q9QVN7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tcea2Q9QVN7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tcea2Q9QVN7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tcea2Q9QVN7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tcea2Q9QVN7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tcea2Q9QVN7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tcea2Q9QVN7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tcea2Q9QVN7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tcea2Q9QVN7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tcea2Q9QVN7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tcea2Q9QVN7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tcea2Q9QVN7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tcea2Q9QVN7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tcea2Q9QVN7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tcea2Q9QVN7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tcea2Q9QVN7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tcea2Q9QVN7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tcea2Q9QVN7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tcea2Q9QVN7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tcea2Q9QVN7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tcea2Q9QVN7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tcea2Q9QVN7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tcea2Q9QVN7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tcea2Q9QVN7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tcea2Q9QVN7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tcea2Q9QVN7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tcea2Q9QVN7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tcea2Q9QVN7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tcea2Q9QVN7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tcea2Q9QVN7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tcea2Q9QVN7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tcea2Q9QVN7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tcea2Q9QVN7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Tcea2Q9QVN7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Tcea2Q9QVN7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tcea2Q9QVN7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tcea2Q9QVN7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tcea2Q9QVN7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tcea2Q9QVN7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tcea2Q9QVN7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tcea2Q9QVN7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tcea2Q9QVN7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tcea2Q9QVN7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tcea2Q9QVN7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tcea2Q9QVN7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tcea2Q9QVN7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tcea2Q9QVN7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tcea2Q9QVN7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tcea2Q9QVN7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tcea2Q9QVN7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tcea2Q9QVN7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tcea2Q9QVN7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tcea2Q9QVN7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tcea2Q9QVN7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tcea2Q9QVN7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tcea2Q9QVN7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tcea2Q9QVN7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tcea2Q9QVN7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tcea2Q9QVN7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tcea2Q9QVN7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tcea2Q9QVN7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tcea2Q9QVN7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tcea2Q9QVN7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tcea2Q9QVN7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tcea2Q9QVN7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tcea2Q9QVN7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tcea2Q9QVN7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tcea2Q9QVN7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tcea2Q9QVN7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tcea2Q9QVN7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tcea2Q9QVN7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tcea2Q9QVN7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tcea2Q9QVN7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tcea2Q9QVN7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tcea2Q9QVN7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tcea2Q9QVN7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tcea2Q9QVN7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tcea2Q9QVN7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tcea2Q9QVN7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tcea2Q9QVN7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tcea2Q9QVN7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tcea2Q9QVN7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tcea2Q9QVN7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tcea2Q9QVN7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tcea2Q9QVN7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tcea2Q9QVN7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tcea2Q9QVN7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tcea2Q9QVN7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tcea2Q9QVN7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tcea2Q9QVN7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.8 ms