Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM9

Psma6, Proteasome subunit alpha type-6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma6Q9QUM9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Psma6Q9QUM9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psma6Q9QUM9 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psma6Q9QUM9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psma6Q9QUM9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Psma6Q9QUM9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psma6Q9QUM9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psma6Q9QUM9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psma6Q9QUM9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psma6Q9QUM9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psma6Q9QUM9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psma6Q9QUM9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psma6Q9QUM9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psma6Q9QUM9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psma6Q9QUM9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psma6Q9QUM9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psma6Q9QUM9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psma6Q9QUM9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psma6Q9QUM9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psma6Q9QUM9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psma6Q9QUM9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Psma6Q9QUM9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psma6Q9QUM9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psma6Q9QUM9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psma6Q9QUM9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psma6Q9QUM9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psma6Q9QUM9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psma6Q9QUM9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psma6Q9QUM9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psma6Q9QUM9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psma6Q9QUM9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psma6Q9QUM9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psma6Q9QUM9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Psma6Q9QUM9 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psma6Q9QUM9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psma6Q9QUM9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psma6Q9QUM9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psma6Q9QUM9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psma6Q9QUM9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psma6Q9QUM9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psma6Q9QUM9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psma6Q9QUM9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psma6Q9QUM9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psma6Q9QUM9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psma6Q9QUM9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psma6Q9QUM9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psma6Q9QUM9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psma6Q9QUM9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psma6Q9QUM9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psma6Q9QUM9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psma6Q9QUM9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psma6Q9QUM9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psma6Q9QUM9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psma6Q9QUM9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psma6Q9QUM9 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psma6Q9QUM9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psma6Q9QUM9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psma6Q9QUM9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psma6Q9QUM9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psma6Q9QUM9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psma6Q9QUM9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psma6Q9QUM9 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psma6Q9QUM9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psma6Q9QUM9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psma6Q9QUM9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psma6Q9QUM9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psma6Q9QUM9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psma6Q9QUM9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psma6Q9QUM9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psma6Q9QUM9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Psma6Q9QUM9 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psma6Q9QUM9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psma6Q9QUM9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psma6Q9QUM9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psma6Q9QUM9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psma6Q9QUM9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Psma6Q9QUM9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Psma6Q9QUM9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Psma6Q9QUM9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Psma6Q9QUM9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Psma6Q9QUM9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psma6Q9QUM9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psma6Q9QUM9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psma6Q9QUM9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psma6Q9QUM9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psma6Q9QUM9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psma6Q9QUM9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psma6Q9QUM9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psma6Q9QUM9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psma6Q9QUM9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psma6Q9QUM9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psma6Q9QUM9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psma6Q9QUM9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psma6Q9QUM9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psma6Q9QUM9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psma6Q9QUM9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psma6Q9QUM9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psma6Q9QUM9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psma6Q9QUM9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psma6Q9QUM9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms