Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG7

Hdgfl3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl3Q9JMG7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdgfl3Q9JMG7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdgfl3Q9JMG7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdgfl3Q9JMG7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdgfl3Q9JMG7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdgfl3Q9JMG7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdgfl3Q9JMG7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdgfl3Q9JMG7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdgfl3Q9JMG7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms