Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc2lQ9JME7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc2lQ9JME7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc2lQ9JME7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc2lQ9JME7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc2lQ9JME7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc2lQ9JME7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc2lQ9JME7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc2lQ9JME7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc2lQ9JME7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc2lQ9JME7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc2lQ9JME7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc2lQ9JME7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc2lQ9JME7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc2lQ9JME7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trappc2lQ9JME7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc2lQ9JME7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc2lQ9JME7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc2lQ9JME7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc2lQ9JME7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc2lQ9JME7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc2lQ9JME7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc2lQ9JME7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc2lQ9JME7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc2lQ9JME7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc2lQ9JME7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc2lQ9JME7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc2lQ9JME7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc2lQ9JME7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc2lQ9JME7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc2lQ9JME7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc2lQ9JME7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc2lQ9JME7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc2lQ9JME7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc2lQ9JME7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc2lQ9JME7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc2lQ9JME7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc2lQ9JME7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc2lQ9JME7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc2lQ9JME7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc2lQ9JME7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc2lQ9JME7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc2lQ9JME7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc2lQ9JME7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc2lQ9JME7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc2lQ9JME7 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc2lQ9JME7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc2lQ9JME7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc2lQ9JME7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc2lQ9JME7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc2lQ9JME7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc2lQ9JME7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc2lQ9JME7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc2lQ9JME7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc2lQ9JME7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc2lQ9JME7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc2lQ9JME7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc2lQ9JME7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc2lQ9JME7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc2lQ9JME7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc2lQ9JME7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc2lQ9JME7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc2lQ9JME7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc2lQ9JME7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc2lQ9JME7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc2lQ9JME7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc2lQ9JME7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc2lQ9JME7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc2lQ9JME7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc2lQ9JME7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc2lQ9JME7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc2lQ9JME7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc2lQ9JME7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc2lQ9JME7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc2lQ9JME7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc2lQ9JME7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc2lQ9JME7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc2lQ9JME7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc2lQ9JME7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc2lQ9JME7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc2lQ9JME7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc2lQ9JME7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc2lQ9JME7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc2lQ9JME7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc2lQ9JME7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc2lQ9JME7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc2lQ9JME7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc2lQ9JME7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc2lQ9JME7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc2lQ9JME7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc2lQ9JME7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc2lQ9JME7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc2lQ9JME7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc2lQ9JME7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc2lQ9JME7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc2lQ9JME7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc2lQ9JME7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc2lQ9JME7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc2lQ9JME7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc2lQ9JME7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms