Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLJ0

Litaf, Lipopolysaccharide-induced tumor necrosis factor-alpha factor homolog, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LitafQ9JLJ0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LitafQ9JLJ0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LitafQ9JLJ0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LitafQ9JLJ0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LitafQ9JLJ0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LitafQ9JLJ0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LitafQ9JLJ0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LitafQ9JLJ0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LitafQ9JLJ0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LitafQ9JLJ0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LitafQ9JLJ0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LitafQ9JLJ0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LitafQ9JLJ0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LitafQ9JLJ0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LitafQ9JLJ0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LitafQ9JLJ0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LitafQ9JLJ0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LitafQ9JLJ0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LitafQ9JLJ0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LitafQ9JLJ0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LitafQ9JLJ0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LitafQ9JLJ0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LitafQ9JLJ0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LitafQ9JLJ0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LitafQ9JLJ0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LitafQ9JLJ0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LitafQ9JLJ0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LitafQ9JLJ0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LitafQ9JLJ0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LitafQ9JLJ0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LitafQ9JLJ0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LitafQ9JLJ0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LitafQ9JLJ0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LitafQ9JLJ0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LitafQ9JLJ0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LitafQ9JLJ0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LitafQ9JLJ0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LitafQ9JLJ0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LitafQ9JLJ0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LitafQ9JLJ0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LitafQ9JLJ0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LitafQ9JLJ0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LitafQ9JLJ0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LitafQ9JLJ0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LitafQ9JLJ0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LitafQ9JLJ0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LitafQ9JLJ0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LitafQ9JLJ0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LitafQ9JLJ0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LitafQ9JLJ0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LitafQ9JLJ0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LitafQ9JLJ0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LitafQ9JLJ0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LitafQ9JLJ0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LitafQ9JLJ0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LitafQ9JLJ0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LitafQ9JLJ0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LitafQ9JLJ0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LitafQ9JLJ0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LitafQ9JLJ0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LitafQ9JLJ0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LitafQ9JLJ0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LitafQ9JLJ0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LitafQ9JLJ0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LitafQ9JLJ0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LitafQ9JLJ0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LitafQ9JLJ0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LitafQ9JLJ0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LitafQ9JLJ0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LitafQ9JLJ0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LitafQ9JLJ0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LitafQ9JLJ0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LitafQ9JLJ0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LitafQ9JLJ0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LitafQ9JLJ0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LitafQ9JLJ0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LitafQ9JLJ0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LitafQ9JLJ0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LitafQ9JLJ0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LitafQ9JLJ0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LitafQ9JLJ0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LitafQ9JLJ0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LitafQ9JLJ0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LitafQ9JLJ0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LitafQ9JLJ0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LitafQ9JLJ0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LitafQ9JLJ0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LitafQ9JLJ0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LitafQ9JLJ0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LitafQ9JLJ0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LitafQ9JLJ0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LitafQ9JLJ0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LitafQ9JLJ0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LitafQ9JLJ0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LitafQ9JLJ0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LitafQ9JLJ0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LitafQ9JLJ0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LitafQ9JLJ0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LitafQ9JLJ0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LitafQ9JLJ0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms