Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB4

Cubn, Cubilin, mousemouse

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Length 3,623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CubnQ9JLB4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CubnQ9JLB4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CubnQ9JLB4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CubnQ9JLB4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CubnQ9JLB4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CubnQ9JLB4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CubnQ9JLB4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CubnQ9JLB4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CubnQ9JLB4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CubnQ9JLB4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CubnQ9JLB4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CubnQ9JLB4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CubnQ9JLB4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CubnQ9JLB4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CubnQ9JLB4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CubnQ9JLB4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CubnQ9JLB4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CubnQ9JLB4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CubnQ9JLB4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CubnQ9JLB4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CubnQ9JLB4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CubnQ9JLB4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CubnQ9JLB4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CubnQ9JLB4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CubnQ9JLB4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CubnQ9JLB4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CubnQ9JLB4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CubnQ9JLB4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CubnQ9JLB4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CubnQ9JLB4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CubnQ9JLB4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CubnQ9JLB4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CubnQ9JLB4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CubnQ9JLB4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CubnQ9JLB4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CubnQ9JLB4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CubnQ9JLB4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CubnQ9JLB4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CubnQ9JLB4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CubnQ9JLB4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CubnQ9JLB4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CubnQ9JLB4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CubnQ9JLB4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CubnQ9JLB4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CubnQ9JLB4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CubnQ9JLB4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CubnQ9JLB4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CubnQ9JLB4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CubnQ9JLB4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CubnQ9JLB4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CubnQ9JLB4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CubnQ9JLB4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CubnQ9JLB4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CubnQ9JLB4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CubnQ9JLB4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CubnQ9JLB4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CubnQ9JLB4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CubnQ9JLB4 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CubnQ9JLB4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CubnQ9JLB4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CubnQ9JLB4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CubnQ9JLB4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CubnQ9JLB4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CubnQ9JLB4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CubnQ9JLB4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CubnQ9JLB4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CubnQ9JLB4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CubnQ9JLB4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CubnQ9JLB4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CubnQ9JLB4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CubnQ9JLB4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CubnQ9JLB4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CubnQ9JLB4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CubnQ9JLB4 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CubnQ9JLB4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CubnQ9JLB4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CubnQ9JLB4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CubnQ9JLB4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CubnQ9JLB4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CubnQ9JLB4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CubnQ9JLB4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CubnQ9JLB4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CubnQ9JLB4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CubnQ9JLB4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CubnQ9JLB4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CubnQ9JLB4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CubnQ9JLB4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CubnQ9JLB4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CubnQ9JLB4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CubnQ9JLB4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CubnQ9JLB4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CubnQ9JLB4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CubnQ9JLB4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CubnQ9JLB4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CubnQ9JLB4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CubnQ9JLB4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CubnQ9JLB4 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CubnQ9JLB4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CubnQ9JLB4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CubnQ9JLB4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms