Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS5

Habp4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp4Q9JKS5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Habp4Q9JKS5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Habp4Q9JKS5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Habp4Q9JKS5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Habp4Q9JKS5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Habp4Q9JKS5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Habp4Q9JKS5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Habp4Q9JKS5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Habp4Q9JKS5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Habp4Q9JKS5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Habp4Q9JKS5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Habp4Q9JKS5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Habp4Q9JKS5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Habp4Q9JKS5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Habp4Q9JKS5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Habp4Q9JKS5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Habp4Q9JKS5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Habp4Q9JKS5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Habp4Q9JKS5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Habp4Q9JKS5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Habp4Q9JKS5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Habp4Q9JKS5 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Habp4Q9JKS5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Habp4Q9JKS5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Habp4Q9JKS5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Habp4Q9JKS5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Habp4Q9JKS5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Habp4Q9JKS5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Habp4Q9JKS5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Habp4Q9JKS5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Habp4Q9JKS5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Habp4Q9JKS5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Habp4Q9JKS5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Habp4Q9JKS5 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Habp4Q9JKS5 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Habp4Q9JKS5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Habp4Q9JKS5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Habp4Q9JKS5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Habp4Q9JKS5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Habp4Q9JKS5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Habp4Q9JKS5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Habp4Q9JKS5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Habp4Q9JKS5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Habp4Q9JKS5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Habp4Q9JKS5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Habp4Q9JKS5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Habp4Q9JKS5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Habp4Q9JKS5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Habp4Q9JKS5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Habp4Q9JKS5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Habp4Q9JKS5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Habp4Q9JKS5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Habp4Q9JKS5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Habp4Q9JKS5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Habp4Q9JKS5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Habp4Q9JKS5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Habp4Q9JKS5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Habp4Q9JKS5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Habp4Q9JKS5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Habp4Q9JKS5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Habp4Q9JKS5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Habp4Q9JKS5 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Habp4Q9JKS5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Habp4Q9JKS5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Habp4Q9JKS5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Habp4Q9JKS5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Habp4Q9JKS5 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Habp4Q9JKS5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Habp4Q9JKS5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Habp4Q9JKS5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Habp4Q9JKS5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Habp4Q9JKS5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Habp4Q9JKS5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Habp4Q9JKS5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Habp4Q9JKS5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Habp4Q9JKS5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Habp4Q9JKS5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Habp4Q9JKS5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Habp4Q9JKS5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Habp4Q9JKS5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Habp4Q9JKS5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Habp4Q9JKS5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Habp4Q9JKS5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Habp4Q9JKS5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Habp4Q9JKS5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Habp4Q9JKS5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Habp4Q9JKS5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Habp4Q9JKS5 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Habp4Q9JKS5 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Habp4Q9JKS5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Habp4Q9JKS5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Habp4Q9JKS5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Habp4Q9JKS5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Habp4Q9JKS5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Habp4Q9JKS5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Habp4Q9JKS5 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Habp4Q9JKS5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Habp4Q9JKS5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Habp4Q9JKS5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Habp4Q9JKS5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms