Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Irx5Q9JKQ4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Irx5Q9JKQ4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Irx5Q9JKQ4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Irx5Q9JKQ4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Irx5Q9JKQ4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Irx5Q9JKQ4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Irx5Q9JKQ4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Irx5Q9JKQ4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Irx5Q9JKQ4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Irx5Q9JKQ4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Irx5Q9JKQ4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Irx5Q9JKQ4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Irx5Q9JKQ4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Irx5Q9JKQ4 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Irx5Q9JKQ4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Irx5Q9JKQ4 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Irx5Q9JKQ4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Irx5Q9JKQ4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Irx5Q9JKQ4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Irx5Q9JKQ4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Irx5Q9JKQ4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Irx5Q9JKQ4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Irx5Q9JKQ4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Irx5Q9JKQ4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Irx5Q9JKQ4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Irx5Q9JKQ4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Irx5Q9JKQ4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Irx5Q9JKQ4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Irx5Q9JKQ4 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Irx5Q9JKQ4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Irx5Q9JKQ4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Irx5Q9JKQ4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Irx5Q9JKQ4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irx5Q9JKQ4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irx5Q9JKQ4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irx5Q9JKQ4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irx5Q9JKQ4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irx5Q9JKQ4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irx5Q9JKQ4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irx5Q9JKQ4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irx5Q9JKQ4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irx5Q9JKQ4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irx5Q9JKQ4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irx5Q9JKQ4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irx5Q9JKQ4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irx5Q9JKQ4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irx5Q9JKQ4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irx5Q9JKQ4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irx5Q9JKQ4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irx5Q9JKQ4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irx5Q9JKQ4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irx5Q9JKQ4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irx5Q9JKQ4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Irx5Q9JKQ4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irx5Q9JKQ4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irx5Q9JKQ4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Irx5Q9JKQ4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Irx5Q9JKQ4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Irx5Q9JKQ4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Irx5Q9JKQ4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Irx5Q9JKQ4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Irx5Q9JKQ4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Irx5Q9JKQ4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Irx5Q9JKQ4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Irx5Q9JKQ4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Irx5Q9JKQ4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Irx5Q9JKQ4 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Irx5Q9JKQ4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Irx5Q9JKQ4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Irx5Q9JKQ4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Irx5Q9JKQ4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Irx5Q9JKQ4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Irx5Q9JKQ4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Irx5Q9JKQ4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irx5Q9JKQ4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irx5Q9JKQ4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irx5Q9JKQ4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irx5Q9JKQ4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irx5Q9JKQ4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Irx5Q9JKQ4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irx5Q9JKQ4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irx5Q9JKQ4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irx5Q9JKQ4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irx5Q9JKQ4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irx5Q9JKQ4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Irx5Q9JKQ4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Irx5Q9JKQ4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Irx5Q9JKQ4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Irx5Q9JKQ4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Irx5Q9JKQ4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Irx5Q9JKQ4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Irx5Q9JKQ4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Irx5Q9JKQ4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Irx5Q9JKQ4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Irx5Q9JKQ4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irx5Q9JKQ4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irx5Q9JKQ4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irx5Q9JKQ4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irx5Q9JKQ4 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms