Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Chrac1Q9JKP8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Chrac1Q9JKP8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Chrac1Q9JKP8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Chrac1Q9JKP8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Chrac1Q9JKP8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Chrac1Q9JKP8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Chrac1Q9JKP8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Chrac1Q9JKP8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Chrac1Q9JKP8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Chrac1Q9JKP8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Chrac1Q9JKP8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Chrac1Q9JKP8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Chrac1Q9JKP8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chrac1Q9JKP8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chrac1Q9JKP8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chrac1Q9JKP8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chrac1Q9JKP8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chrac1Q9JKP8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chrac1Q9JKP8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chrac1Q9JKP8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chrac1Q9JKP8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chrac1Q9JKP8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chrac1Q9JKP8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Chrac1Q9JKP8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chrac1Q9JKP8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chrac1Q9JKP8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chrac1Q9JKP8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chrac1Q9JKP8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chrac1Q9JKP8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chrac1Q9JKP8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chrac1Q9JKP8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Chrac1Q9JKP8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chrac1Q9JKP8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chrac1Q9JKP8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chrac1Q9JKP8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chrac1Q9JKP8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chrac1Q9JKP8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chrac1Q9JKP8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chrac1Q9JKP8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chrac1Q9JKP8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chrac1Q9JKP8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chrac1Q9JKP8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chrac1Q9JKP8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chrac1Q9JKP8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chrac1Q9JKP8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chrac1Q9JKP8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chrac1Q9JKP8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chrac1Q9JKP8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chrac1Q9JKP8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chrac1Q9JKP8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Chrac1Q9JKP8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chrac1Q9JKP8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chrac1Q9JKP8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chrac1Q9JKP8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chrac1Q9JKP8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chrac1Q9JKP8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chrac1Q9JKP8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chrac1Q9JKP8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Chrac1Q9JKP8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chrac1Q9JKP8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chrac1Q9JKP8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chrac1Q9JKP8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chrac1Q9JKP8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chrac1Q9JKP8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chrac1Q9JKP8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chrac1Q9JKP8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chrac1Q9JKP8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chrac1Q9JKP8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Chrac1Q9JKP8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chrac1Q9JKP8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chrac1Q9JKP8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chrac1Q9JKP8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chrac1Q9JKP8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chrac1Q9JKP8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chrac1Q9JKP8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chrac1Q9JKP8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chrac1Q9JKP8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Chrac1Q9JKP8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Chrac1Q9JKP8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Chrac1Q9JKP8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Chrac1Q9JKP8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Chrac1Q9JKP8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Chrac1Q9JKP8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Chrac1Q9JKP8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Chrac1Q9JKP8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Chrac1Q9JKP8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.66
Chrac1Q9JKP8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Chrac1Q9JKP8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Chrac1Q9JKP8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Chrac1Q9JKP8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Chrac1Q9JKP8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Chrac1Q9JKP8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Chrac1Q9JKP8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Chrac1Q9JKP8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Chrac1Q9JKP8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Chrac1Q9JKP8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Chrac1Q9JKP8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Chrac1Q9JKP8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Chrac1Q9JKP8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms