Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nectin1Q9JKF6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nectin1Q9JKF6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nectin1Q9JKF6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nectin1Q9JKF6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Nectin1Q9JKF6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nectin1Q9JKF6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nectin1Q9JKF6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nectin1Q9JKF6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nectin1Q9JKF6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nectin1Q9JKF6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nectin1Q9JKF6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nectin1Q9JKF6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nectin1Q9JKF6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nectin1Q9JKF6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nectin1Q9JKF6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nectin1Q9JKF6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nectin1Q9JKF6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nectin1Q9JKF6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nectin1Q9JKF6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nectin1Q9JKF6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nectin1Q9JKF6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nectin1Q9JKF6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nectin1Q9JKF6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nectin1Q9JKF6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nectin1Q9JKF6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nectin1Q9JKF6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nectin1Q9JKF6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Nectin1Q9JKF6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nectin1Q9JKF6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nectin1Q9JKF6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nectin1Q9JKF6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nectin1Q9JKF6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nectin1Q9JKF6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nectin1Q9JKF6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nectin1Q9JKF6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nectin1Q9JKF6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nectin1Q9JKF6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nectin1Q9JKF6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nectin1Q9JKF6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nectin1Q9JKF6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nectin1Q9JKF6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nectin1Q9JKF6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nectin1Q9JKF6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nectin1Q9JKF6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nectin1Q9JKF6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nectin1Q9JKF6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nectin1Q9JKF6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nectin1Q9JKF6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nectin1Q9JKF6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nectin1Q9JKF6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Nectin1Q9JKF6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nectin1Q9JKF6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nectin1Q9JKF6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nectin1Q9JKF6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nectin1Q9JKF6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nectin1Q9JKF6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nectin1Q9JKF6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nectin1Q9JKF6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Nectin1Q9JKF6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nectin1Q9JKF6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nectin1Q9JKF6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nectin1Q9JKF6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nectin1Q9JKF6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nectin1Q9JKF6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nectin1Q9JKF6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nectin1Q9JKF6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nectin1Q9JKF6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nectin1Q9JKF6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nectin1Q9JKF6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nectin1Q9JKF6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nectin1Q9JKF6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nectin1Q9JKF6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nectin1Q9JKF6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nectin1Q9JKF6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nectin1Q9JKF6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nectin1Q9JKF6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nectin1Q9JKF6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nectin1Q9JKF6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nectin1Q9JKF6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nectin1Q9JKF6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nectin1Q9JKF6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nectin1Q9JKF6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nectin1Q9JKF6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nectin1Q9JKF6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nectin1Q9JKF6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nectin1Q9JKF6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nectin1Q9JKF6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nectin1Q9JKF6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nectin1Q9JKF6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nectin1Q9JKF6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nectin1Q9JKF6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nectin1Q9JKF6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nectin1Q9JKF6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nectin1Q9JKF6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nectin1Q9JKF6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nectin1Q9JKF6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nectin1Q9JKF6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nectin1Q9JKF6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nectin1Q9JKF6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms