Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC7

Ap4m1, AP-4 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4m1Q9JKC7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ap4m1Q9JKC7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ap4m1Q9JKC7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ap4m1Q9JKC7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ap4m1Q9JKC7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ap4m1Q9JKC7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ap4m1Q9JKC7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ap4m1Q9JKC7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ap4m1Q9JKC7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ap4m1Q9JKC7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ap4m1Q9JKC7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ap4m1Q9JKC7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ap4m1Q9JKC7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ap4m1Q9JKC7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ap4m1Q9JKC7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ap4m1Q9JKC7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ap4m1Q9JKC7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ap4m1Q9JKC7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ap4m1Q9JKC7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ap4m1Q9JKC7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ap4m1Q9JKC7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ap4m1Q9JKC7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ap4m1Q9JKC7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ap4m1Q9JKC7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap4m1Q9JKC7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap4m1Q9JKC7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap4m1Q9JKC7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap4m1Q9JKC7 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap4m1Q9JKC7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap4m1Q9JKC7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap4m1Q9JKC7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap4m1Q9JKC7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap4m1Q9JKC7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap4m1Q9JKC7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap4m1Q9JKC7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap4m1Q9JKC7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap4m1Q9JKC7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap4m1Q9JKC7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap4m1Q9JKC7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap4m1Q9JKC7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap4m1Q9JKC7 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap4m1Q9JKC7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap4m1Q9JKC7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ap4m1Q9JKC7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms