Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ybx3Q9JKB3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ybx3Q9JKB3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ybx3Q9JKB3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ybx3Q9JKB3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ybx3Q9JKB3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ybx3Q9JKB3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ybx3Q9JKB3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ybx3Q9JKB3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ybx3Q9JKB3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ybx3Q9JKB3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ybx3Q9JKB3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ybx3Q9JKB3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ybx3Q9JKB3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ybx3Q9JKB3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ybx3Q9JKB3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ybx3Q9JKB3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ybx3Q9JKB3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ybx3Q9JKB3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ybx3Q9JKB3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ybx3Q9JKB3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ybx3Q9JKB3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ybx3Q9JKB3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ybx3Q9JKB3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Ybx3Q9JKB3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Ybx3Q9JKB3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ybx3Q9JKB3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ybx3Q9JKB3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ybx3Q9JKB3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Ybx3Q9JKB3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Ybx3Q9JKB3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Ybx3Q9JKB3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ybx3Q9JKB3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ybx3Q9JKB3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ybx3Q9JKB3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ybx3Q9JKB3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ybx3Q9JKB3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Ybx3Q9JKB3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ybx3Q9JKB3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ybx3Q9JKB3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ybx3Q9JKB3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ybx3Q9JKB3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ybx3Q9JKB3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ybx3Q9JKB3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ybx3Q9JKB3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ybx3Q9JKB3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ybx3Q9JKB3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ybx3Q9JKB3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ybx3Q9JKB3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Ybx3Q9JKB3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ybx3Q9JKB3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ybx3Q9JKB3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ybx3Q9JKB3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ybx3Q9JKB3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ybx3Q9JKB3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ybx3Q9JKB3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ybx3Q9JKB3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ybx3Q9JKB3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ybx3Q9JKB3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ybx3Q9JKB3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ybx3Q9JKB3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ybx3Q9JKB3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ybx3Q9JKB3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ybx3Q9JKB3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ybx3Q9JKB3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ybx3Q9JKB3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ybx3Q9JKB3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
Ybx3Q9JKB3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ybx3Q9JKB3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ybx3Q9JKB3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ybx3Q9JKB3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ybx3Q9JKB3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ybx3Q9JKB3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ybx3Q9JKB3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ybx3Q9JKB3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ybx3Q9JKB3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Ybx3Q9JKB3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ybx3Q9JKB3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ybx3Q9JKB3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ybx3Q9JKB3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ybx3Q9JKB3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ybx3Q9JKB3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ybx3Q9JKB3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ybx3Q9JKB3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ybx3Q9JKB3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ybx3Q9JKB3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ybx3Q9JKB3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ybx3Q9JKB3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ybx3Q9JKB3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ybx3Q9JKB3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ybx3Q9JKB3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ybx3Q9JKB3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ybx3Q9JKB3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ybx3Q9JKB3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ybx3Q9JKB3 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ybx3Q9JKB3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Ybx3Q9JKB3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ybx3Q9JKB3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ybx3Q9JKB3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ybx3Q9JKB3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms