Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Tuba8Q9JJZ2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tuba8Q9JJZ2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Tuba8Q9JJZ2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Tuba8Q9JJZ2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Tuba8Q9JJZ2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tuba8Q9JJZ2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Tuba8Q9JJZ2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tuba8Q9JJZ2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tuba8Q9JJZ2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tuba8Q9JJZ2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Tuba8Q9JJZ2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tuba8Q9JJZ2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Tuba8Q9JJZ2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tuba8Q9JJZ2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tuba8Q9JJZ2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tuba8Q9JJZ2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Tuba8Q9JJZ2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tuba8Q9JJZ2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tuba8Q9JJZ2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tuba8Q9JJZ2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tuba8Q9JJZ2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tuba8Q9JJZ2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tuba8Q9JJZ2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
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Tuba8Q9JJZ2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tuba8Q9JJZ2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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Tuba8Q9JJZ2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tuba8Q9JJZ2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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Tuba8Q9JJZ2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tuba8Q9JJZ2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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Tuba8Q9JJZ2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tuba8Q9JJZ2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
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Tuba8Q9JJZ2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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Tuba8Q9JJZ2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tuba8Q9JJZ2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Tuba8Q9JJZ2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tuba8Q9JJZ2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Tuba8Q9JJZ2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tuba8Q9JJZ2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tuba8Q9JJZ2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tuba8Q9JJZ2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tuba8Q9JJZ2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tuba8Q9JJZ2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tuba8Q9JJZ2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tuba8Q9JJZ2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tuba8Q9JJZ2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tuba8Q9JJZ2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tuba8Q9JJZ2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tuba8Q9JJZ2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tuba8Q9JJZ2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tuba8Q9JJZ2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tuba8Q9JJZ2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tuba8Q9JJZ2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tuba8Q9JJZ2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tuba8Q9JJZ2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tuba8Q9JJZ2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tuba8Q9JJZ2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms