Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIZ5

Tfap4, Activator protein 4, mousemouse

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap4Q9JIZ5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tfap4Q9JIZ5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tfap4Q9JIZ5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Tfap4Q9JIZ5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tfap4Q9JIZ5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Tfap4Q9JIZ5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Tfap4Q9JIZ5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tfap4Q9JIZ5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tfap4Q9JIZ5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tfap4Q9JIZ5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tfap4Q9JIZ5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tfap4Q9JIZ5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tfap4Q9JIZ5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tfap4Q9JIZ5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tfap4Q9JIZ5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tfap4Q9JIZ5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tfap4Q9JIZ5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tfap4Q9JIZ5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tfap4Q9JIZ5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tfap4Q9JIZ5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tfap4Q9JIZ5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tfap4Q9JIZ5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tfap4Q9JIZ5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tfap4Q9JIZ5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tfap4Q9JIZ5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tfap4Q9JIZ5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tfap4Q9JIZ5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tfap4Q9JIZ5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tfap4Q9JIZ5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tfap4Q9JIZ5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tfap4Q9JIZ5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tfap4Q9JIZ5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tfap4Q9JIZ5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tfap4Q9JIZ5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tfap4Q9JIZ5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tfap4Q9JIZ5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tfap4Q9JIZ5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Tfap4Q9JIZ5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tfap4Q9JIZ5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tfap4Q9JIZ5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tfap4Q9JIZ5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tfap4Q9JIZ5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tfap4Q9JIZ5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tfap4Q9JIZ5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tfap4Q9JIZ5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tfap4Q9JIZ5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tfap4Q9JIZ5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tfap4Q9JIZ5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tfap4Q9JIZ5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tfap4Q9JIZ5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tfap4Q9JIZ5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tfap4Q9JIZ5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tfap4Q9JIZ5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tfap4Q9JIZ5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tfap4Q9JIZ5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tfap4Q9JIZ5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tfap4Q9JIZ5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tfap4Q9JIZ5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tfap4Q9JIZ5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tfap4Q9JIZ5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tfap4Q9JIZ5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tfap4Q9JIZ5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tfap4Q9JIZ5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tfap4Q9JIZ5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tfap4Q9JIZ5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tfap4Q9JIZ5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tfap4Q9JIZ5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tfap4Q9JIZ5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tfap4Q9JIZ5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tfap4Q9JIZ5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tfap4Q9JIZ5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tfap4Q9JIZ5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tfap4Q9JIZ5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tfap4Q9JIZ5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tfap4Q9JIZ5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tfap4Q9JIZ5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tfap4Q9JIZ5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tfap4Q9JIZ5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tfap4Q9JIZ5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tfap4Q9JIZ5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tfap4Q9JIZ5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tfap4Q9JIZ5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tfap4Q9JIZ5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tfap4Q9JIZ5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tfap4Q9JIZ5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Tfap4Q9JIZ5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Tfap4Q9JIZ5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Tfap4Q9JIZ5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tfap4Q9JIZ5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tfap4Q9JIZ5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tfap4Q9JIZ5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tfap4Q9JIZ5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tfap4Q9JIZ5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tfap4Q9JIZ5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Tfap4Q9JIZ5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tfap4Q9JIZ5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tfap4Q9JIZ5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tfap4Q9JIZ5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tfap4Q9JIZ5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tfap4Q9JIZ5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms