Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmbr1Q9JIT0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmbr1Q9JIT0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmbr1Q9JIT0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmbr1Q9JIT0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmbr1Q9JIT0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmbr1Q9JIT0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lmbr1Q9JIT0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lmbr1Q9JIT0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lmbr1Q9JIT0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lmbr1Q9JIT0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lmbr1Q9JIT0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lmbr1Q9JIT0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lmbr1Q9JIT0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lmbr1Q9JIT0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lmbr1Q9JIT0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Lmbr1Q9JIT0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lmbr1Q9JIT0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmbr1Q9JIT0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmbr1Q9JIT0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmbr1Q9JIT0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmbr1Q9JIT0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmbr1Q9JIT0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmbr1Q9JIT0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmbr1Q9JIT0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmbr1Q9JIT0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmbr1Q9JIT0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmbr1Q9JIT0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmbr1Q9JIT0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmbr1Q9JIT0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmbr1Q9JIT0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmbr1Q9JIT0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmbr1Q9JIT0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmbr1Q9JIT0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmbr1Q9JIT0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmbr1Q9JIT0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmbr1Q9JIT0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmbr1Q9JIT0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmbr1Q9JIT0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmbr1Q9JIT0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmbr1Q9JIT0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmbr1Q9JIT0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmbr1Q9JIT0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmbr1Q9JIT0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmbr1Q9JIT0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmbr1Q9JIT0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmbr1Q9JIT0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmbr1Q9JIT0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmbr1Q9JIT0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmbr1Q9JIT0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmbr1Q9JIT0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmbr1Q9JIT0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmbr1Q9JIT0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmbr1Q9JIT0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmbr1Q9JIT0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmbr1Q9JIT0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmbr1Q9JIT0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmbr1Q9JIT0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmbr1Q9JIT0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmbr1Q9JIT0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmbr1Q9JIT0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmbr1Q9JIT0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmbr1Q9JIT0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmbr1Q9JIT0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmbr1Q9JIT0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmbr1Q9JIT0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmbr1Q9JIT0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmbr1Q9JIT0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmbr1Q9JIT0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmbr1Q9JIT0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmbr1Q9JIT0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmbr1Q9JIT0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmbr1Q9JIT0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmbr1Q9JIT0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmbr1Q9JIT0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmbr1Q9JIT0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmbr1Q9JIT0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmbr1Q9JIT0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmbr1Q9JIT0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmbr1Q9JIT0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmbr1Q9JIT0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmbr1Q9JIT0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmbr1Q9JIT0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmbr1Q9JIT0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmbr1Q9JIT0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmbr1Q9JIT0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Lmbr1Q9JIT0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmbr1Q9JIT0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmbr1Q9JIT0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmbr1Q9JIT0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmbr1Q9JIT0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmbr1Q9JIT0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmbr1Q9JIT0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmbr1Q9JIT0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmbr1Q9JIT0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmbr1Q9JIT0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmbr1Q9JIT0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmbr1Q9JIT0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmbr1Q9JIT0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmbr1Q9JIT0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms