Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod3Q9JHJ0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tmod3Q9JHJ0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tmod3Q9JHJ0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmod3Q9JHJ0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmod3Q9JHJ0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmod3Q9JHJ0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmod3Q9JHJ0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmod3Q9JHJ0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmod3Q9JHJ0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmod3Q9JHJ0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmod3Q9JHJ0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmod3Q9JHJ0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmod3Q9JHJ0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmod3Q9JHJ0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmod3Q9JHJ0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmod3Q9JHJ0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmod3Q9JHJ0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmod3Q9JHJ0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmod3Q9JHJ0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmod3Q9JHJ0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmod3Q9JHJ0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmod3Q9JHJ0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmod3Q9JHJ0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmod3Q9JHJ0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmod3Q9JHJ0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmod3Q9JHJ0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmod3Q9JHJ0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmod3Q9JHJ0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmod3Q9JHJ0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmod3Q9JHJ0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmod3Q9JHJ0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmod3Q9JHJ0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmod3Q9JHJ0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmod3Q9JHJ0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmod3Q9JHJ0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmod3Q9JHJ0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmod3Q9JHJ0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmod3Q9JHJ0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmod3Q9JHJ0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmod3Q9JHJ0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmod3Q9JHJ0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmod3Q9JHJ0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmod3Q9JHJ0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmod3Q9JHJ0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmod3Q9JHJ0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmod3Q9JHJ0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmod3Q9JHJ0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmod3Q9JHJ0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmod3Q9JHJ0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmod3Q9JHJ0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmod3Q9JHJ0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmod3Q9JHJ0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmod3Q9JHJ0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmod3Q9JHJ0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmod3Q9JHJ0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmod3Q9JHJ0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmod3Q9JHJ0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmod3Q9JHJ0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmod3Q9JHJ0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmod3Q9JHJ0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tmod3Q9JHJ0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tmod3Q9JHJ0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmod3Q9JHJ0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmod3Q9JHJ0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tmod3Q9JHJ0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmod3Q9JHJ0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmod3Q9JHJ0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmod3Q9JHJ0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tmod3Q9JHJ0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmod3Q9JHJ0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmod3Q9JHJ0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmod3Q9JHJ0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tmod3Q9JHJ0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmod3Q9JHJ0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmod3Q9JHJ0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.31■■□□□ 1
Tmod3Q9JHJ0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tmod3Q9JHJ0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmod3Q9JHJ0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tmod3Q9JHJ0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tmod3Q9JHJ0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tmod3Q9JHJ0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmod3Q9JHJ0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmod3Q9JHJ0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tmod3Q9JHJ0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmod3Q9JHJ0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmod3Q9JHJ0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tmod3Q9JHJ0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmod3Q9JHJ0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmod3Q9JHJ0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmod3Q9JHJ0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Tmod3Q9JHJ0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmod3Q9JHJ0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmod3Q9JHJ0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmod3Q9JHJ0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Tmod3Q9JHJ0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Tmod3Q9JHJ0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmod3Q9JHJ0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmod3Q9JHJ0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tmod3Q9JHJ0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tmod3Q9JHJ0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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