Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc4Q9ES56 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc4Q9ES56 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc4Q9ES56 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc4Q9ES56 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc4Q9ES56 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc4Q9ES56 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc4Q9ES56 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc4Q9ES56 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc4Q9ES56 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc4Q9ES56 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc4Q9ES56 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc4Q9ES56 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc4Q9ES56 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc4Q9ES56 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc4Q9ES56 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc4Q9ES56 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc4Q9ES56 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc4Q9ES56 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc4Q9ES56 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc4Q9ES56 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc4Q9ES56 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc4Q9ES56 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc4Q9ES56 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc4Q9ES56 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc4Q9ES56 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc4Q9ES56 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc4Q9ES56 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trappc4Q9ES56 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trappc4Q9ES56 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc4Q9ES56 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc4Q9ES56 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc4Q9ES56 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc4Q9ES56 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc4Q9ES56 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc4Q9ES56 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc4Q9ES56 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc4Q9ES56 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc4Q9ES56 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc4Q9ES56 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc4Q9ES56 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc4Q9ES56 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc4Q9ES56 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc4Q9ES56 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc4Q9ES56 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc4Q9ES56 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc4Q9ES56 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc4Q9ES56 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc4Q9ES56 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc4Q9ES56 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc4Q9ES56 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc4Q9ES56 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc4Q9ES56 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc4Q9ES56 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc4Q9ES56 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc4Q9ES56 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc4Q9ES56 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc4Q9ES56 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc4Q9ES56 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc4Q9ES56 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc4Q9ES56 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc4Q9ES56 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc4Q9ES56 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc4Q9ES56 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc4Q9ES56 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc4Q9ES56 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc4Q9ES56 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc4Q9ES56 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc4Q9ES56 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc4Q9ES56 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc4Q9ES56 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc4Q9ES56 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc4Q9ES56 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc4Q9ES56 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc4Q9ES56 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc4Q9ES56 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc4Q9ES56 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc4Q9ES56 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc4Q9ES56 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc4Q9ES56 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc4Q9ES56 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc4Q9ES56 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc4Q9ES56 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc4Q9ES56 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc4Q9ES56 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc4Q9ES56 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc4Q9ES56 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc4Q9ES56 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc4Q9ES56 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc4Q9ES56 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc4Q9ES56 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc4Q9ES56 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc4Q9ES56 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc4Q9ES56 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc4Q9ES56 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc4Q9ES56 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc4Q9ES56 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc4Q9ES56 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc4Q9ES56 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc4Q9ES56 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms