Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dap3Q9ER88 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dap3Q9ER88 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dap3Q9ER88 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dap3Q9ER88 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dap3Q9ER88 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dap3Q9ER88 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dap3Q9ER88 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dap3Q9ER88 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dap3Q9ER88 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dap3Q9ER88 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dap3Q9ER88 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dap3Q9ER88 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dap3Q9ER88 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dap3Q9ER88 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dap3Q9ER88 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dap3Q9ER88 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dap3Q9ER88 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dap3Q9ER88 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Dap3Q9ER88 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dap3Q9ER88 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dap3Q9ER88 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dap3Q9ER88 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dap3Q9ER88 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dap3Q9ER88 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dap3Q9ER88 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dap3Q9ER88 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dap3Q9ER88 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dap3Q9ER88 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Dap3Q9ER88 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dap3Q9ER88 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dap3Q9ER88 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dap3Q9ER88 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dap3Q9ER88 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dap3Q9ER88 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dap3Q9ER88 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dap3Q9ER88 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dap3Q9ER88 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dap3Q9ER88 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Dap3Q9ER88 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dap3Q9ER88 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dap3Q9ER88 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dap3Q9ER88 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dap3Q9ER88 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dap3Q9ER88 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dap3Q9ER88 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dap3Q9ER88 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dap3Q9ER88 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dap3Q9ER88 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dap3Q9ER88 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dap3Q9ER88 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dap3Q9ER88 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dap3Q9ER88 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dap3Q9ER88 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dap3Q9ER88 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dap3Q9ER88 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dap3Q9ER88 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dap3Q9ER88 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dap3Q9ER88 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dap3Q9ER88 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dap3Q9ER88 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dap3Q9ER88 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dap3Q9ER88 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Dap3Q9ER88 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dap3Q9ER88 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dap3Q9ER88 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dap3Q9ER88 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dap3Q9ER88 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dap3Q9ER88 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dap3Q9ER88 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dap3Q9ER88 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Dap3Q9ER88 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dap3Q9ER88 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dap3Q9ER88 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dap3Q9ER88 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dap3Q9ER88 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dap3Q9ER88 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dap3Q9ER88 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dap3Q9ER88 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dap3Q9ER88 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dap3Q9ER88 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dap3Q9ER88 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dap3Q9ER88 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dap3Q9ER88 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dap3Q9ER88 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Dap3Q9ER88 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dap3Q9ER88 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dap3Q9ER88 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dap3Q9ER88 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dap3Q9ER88 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dap3Q9ER88 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dap3Q9ER88 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dap3Q9ER88 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dap3Q9ER88 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dap3Q9ER88 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dap3Q9ER88 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dap3Q9ER88 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dap3Q9ER88 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dap3Q9ER88 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dap3Q9ER88 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms