Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER63

Tnfrsf23, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 23, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf23Q9ER63 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms