Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQU3

Tlr9, Toll-like receptor 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr9Q9EQU3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tlr9Q9EQU3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tlr9Q9EQU3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tlr9Q9EQU3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tlr9Q9EQU3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tlr9Q9EQU3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tlr9Q9EQU3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tlr9Q9EQU3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tlr9Q9EQU3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tlr9Q9EQU3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tlr9Q9EQU3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tlr9Q9EQU3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tlr9Q9EQU3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tlr9Q9EQU3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tlr9Q9EQU3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tlr9Q9EQU3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tlr9Q9EQU3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tlr9Q9EQU3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tlr9Q9EQU3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tlr9Q9EQU3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tlr9Q9EQU3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tlr9Q9EQU3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tlr9Q9EQU3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tlr9Q9EQU3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tlr9Q9EQU3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tlr9Q9EQU3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tlr9Q9EQU3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tlr9Q9EQU3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tlr9Q9EQU3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tlr9Q9EQU3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Tlr9Q9EQU3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tlr9Q9EQU3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tlr9Q9EQU3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tlr9Q9EQU3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tlr9Q9EQU3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tlr9Q9EQU3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Tlr9Q9EQU3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tlr9Q9EQU3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tlr9Q9EQU3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tlr9Q9EQU3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tlr9Q9EQU3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tlr9Q9EQU3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tlr9Q9EQU3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tlr9Q9EQU3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tlr9Q9EQU3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tlr9Q9EQU3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tlr9Q9EQU3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tlr9Q9EQU3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tlr9Q9EQU3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Tlr9Q9EQU3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tlr9Q9EQU3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tlr9Q9EQU3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tlr9Q9EQU3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tlr9Q9EQU3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tlr9Q9EQU3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tlr9Q9EQU3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tlr9Q9EQU3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tlr9Q9EQU3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tlr9Q9EQU3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tlr9Q9EQU3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tlr9Q9EQU3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tlr9Q9EQU3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tlr9Q9EQU3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tlr9Q9EQU3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tlr9Q9EQU3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tlr9Q9EQU3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tlr9Q9EQU3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tlr9Q9EQU3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tlr9Q9EQU3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tlr9Q9EQU3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tlr9Q9EQU3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tlr9Q9EQU3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Tlr9Q9EQU3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tlr9Q9EQU3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tlr9Q9EQU3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Tlr9Q9EQU3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tlr9Q9EQU3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tlr9Q9EQU3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tlr9Q9EQU3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tlr9Q9EQU3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tlr9Q9EQU3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tlr9Q9EQU3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tlr9Q9EQU3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tlr9Q9EQU3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tlr9Q9EQU3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tlr9Q9EQU3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tlr9Q9EQU3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tlr9Q9EQU3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tlr9Q9EQU3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tlr9Q9EQU3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tlr9Q9EQU3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tlr9Q9EQU3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tlr9Q9EQU3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Tlr9Q9EQU3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tlr9Q9EQU3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Tlr9Q9EQU3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tlr9Q9EQU3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tlr9Q9EQU3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tlr9Q9EQU3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tlr9Q9EQU3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms