Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQR3

Kcnn1, Small conductance calcium-activated potassium channel protein 1, mousemouse

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Length 537 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnn1Q9EQR3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kcnn1Q9EQR3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Kcnn1Q9EQR3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kcnn1Q9EQR3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kcnn1Q9EQR3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kcnn1Q9EQR3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kcnn1Q9EQR3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kcnn1Q9EQR3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kcnn1Q9EQR3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kcnn1Q9EQR3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kcnn1Q9EQR3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kcnn1Q9EQR3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kcnn1Q9EQR3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kcnn1Q9EQR3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kcnn1Q9EQR3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kcnn1Q9EQR3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kcnn1Q9EQR3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Kcnn1Q9EQR3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kcnn1Q9EQR3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kcnn1Q9EQR3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kcnn1Q9EQR3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kcnn1Q9EQR3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kcnn1Q9EQR3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Kcnn1Q9EQR3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kcnn1Q9EQR3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kcnn1Q9EQR3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kcnn1Q9EQR3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kcnn1Q9EQR3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kcnn1Q9EQR3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kcnn1Q9EQR3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kcnn1Q9EQR3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kcnn1Q9EQR3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kcnn1Q9EQR3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Kcnn1Q9EQR3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kcnn1Q9EQR3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Kcnn1Q9EQR3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kcnn1Q9EQR3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kcnn1Q9EQR3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kcnn1Q9EQR3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kcnn1Q9EQR3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Kcnn1Q9EQR3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Kcnn1Q9EQR3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Kcnn1Q9EQR3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Kcnn1Q9EQR3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Kcnn1Q9EQR3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Kcnn1Q9EQR3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Kcnn1Q9EQR3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Kcnn1Q9EQR3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Kcnn1Q9EQR3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Kcnn1Q9EQR3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Kcnn1Q9EQR3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kcnn1Q9EQR3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kcnn1Q9EQR3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kcnn1Q9EQR3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kcnn1Q9EQR3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kcnn1Q9EQR3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kcnn1Q9EQR3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Kcnn1Q9EQR3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kcnn1Q9EQR3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kcnn1Q9EQR3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kcnn1Q9EQR3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kcnn1Q9EQR3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Kcnn1Q9EQR3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kcnn1Q9EQR3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kcnn1Q9EQR3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kcnn1Q9EQR3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kcnn1Q9EQR3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kcnn1Q9EQR3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kcnn1Q9EQR3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kcnn1Q9EQR3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kcnn1Q9EQR3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kcnn1Q9EQR3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kcnn1Q9EQR3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kcnn1Q9EQR3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kcnn1Q9EQR3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kcnn1Q9EQR3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kcnn1Q9EQR3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kcnn1Q9EQR3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kcnn1Q9EQR3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kcnn1Q9EQR3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kcnn1Q9EQR3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Kcnn1Q9EQR3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kcnn1Q9EQR3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kcnn1Q9EQR3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kcnn1Q9EQR3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kcnn1Q9EQR3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kcnn1Q9EQR3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kcnn1Q9EQR3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kcnn1Q9EQR3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kcnn1Q9EQR3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kcnn1Q9EQR3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kcnn1Q9EQR3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Kcnn1Q9EQR3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kcnn1Q9EQR3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kcnn1Q9EQR3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kcnn1Q9EQR3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kcnn1Q9EQR3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Kcnn1Q9EQR3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kcnn1Q9EQR3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kcnn1Q9EQR3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms