Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQG9

Col4a3bp, Collagen type IV alpha-3-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3bpQ9EQG9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col4a3bpQ9EQG9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col4a3bpQ9EQG9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col4a3bpQ9EQG9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col4a3bpQ9EQG9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col4a3bpQ9EQG9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col4a3bpQ9EQG9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col4a3bpQ9EQG9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col4a3bpQ9EQG9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Col4a3bpQ9EQG9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col4a3bpQ9EQG9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col4a3bpQ9EQG9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col4a3bpQ9EQG9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col4a3bpQ9EQG9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col4a3bpQ9EQG9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col4a3bpQ9EQG9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Col4a3bpQ9EQG9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Col4a3bpQ9EQG9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Col4a3bpQ9EQG9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col4a3bpQ9EQG9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col4a3bpQ9EQG9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col4a3bpQ9EQG9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col4a3bpQ9EQG9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col4a3bpQ9EQG9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col4a3bpQ9EQG9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col4a3bpQ9EQG9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col4a3bpQ9EQG9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col4a3bpQ9EQG9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col4a3bpQ9EQG9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Col4a3bpQ9EQG9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Col4a3bpQ9EQG9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col4a3bpQ9EQG9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col4a3bpQ9EQG9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col4a3bpQ9EQG9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col4a3bpQ9EQG9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Col4a3bpQ9EQG9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col4a3bpQ9EQG9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col4a3bpQ9EQG9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col4a3bpQ9EQG9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col4a3bpQ9EQG9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col4a3bpQ9EQG9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col4a3bpQ9EQG9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col4a3bpQ9EQG9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Col4a3bpQ9EQG9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col4a3bpQ9EQG9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col4a3bpQ9EQG9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col4a3bpQ9EQG9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col4a3bpQ9EQG9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col4a3bpQ9EQG9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col4a3bpQ9EQG9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col4a3bpQ9EQG9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col4a3bpQ9EQG9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col4a3bpQ9EQG9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col4a3bpQ9EQG9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col4a3bpQ9EQG9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col4a3bpQ9EQG9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col4a3bpQ9EQG9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col4a3bpQ9EQG9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Col4a3bpQ9EQG9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col4a3bpQ9EQG9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col4a3bpQ9EQG9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col4a3bpQ9EQG9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col4a3bpQ9EQG9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col4a3bpQ9EQG9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col4a3bpQ9EQG9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col4a3bpQ9EQG9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col4a3bpQ9EQG9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col4a3bpQ9EQG9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col4a3bpQ9EQG9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col4a3bpQ9EQG9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col4a3bpQ9EQG9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col4a3bpQ9EQG9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col4a3bpQ9EQG9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col4a3bpQ9EQG9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col4a3bpQ9EQG9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col4a3bpQ9EQG9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col4a3bpQ9EQG9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col4a3bpQ9EQG9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col4a3bpQ9EQG9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Col4a3bpQ9EQG9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Col4a3bpQ9EQG9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col4a3bpQ9EQG9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col4a3bpQ9EQG9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col4a3bpQ9EQG9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col4a3bpQ9EQG9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col4a3bpQ9EQG9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Col4a3bpQ9EQG9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Col4a3bpQ9EQG9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col4a3bpQ9EQG9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col4a3bpQ9EQG9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col4a3bpQ9EQG9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col4a3bpQ9EQG9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col4a3bpQ9EQG9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col4a3bpQ9EQG9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col4a3bpQ9EQG9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col4a3bpQ9EQG9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col4a3bpQ9EQG9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col4a3bpQ9EQG9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col4a3bpQ9EQG9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col4a3bpQ9EQG9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms