Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD6

Gabarap, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabarapQ9DCD6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GabarapQ9DCD6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GabarapQ9DCD6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GabarapQ9DCD6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GabarapQ9DCD6 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GabarapQ9DCD6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GabarapQ9DCD6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GabarapQ9DCD6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GabarapQ9DCD6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GabarapQ9DCD6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GabarapQ9DCD6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GabarapQ9DCD6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GabarapQ9DCD6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GabarapQ9DCD6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GabarapQ9DCD6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GabarapQ9DCD6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GabarapQ9DCD6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GabarapQ9DCD6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GabarapQ9DCD6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GabarapQ9DCD6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GabarapQ9DCD6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GabarapQ9DCD6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GabarapQ9DCD6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GabarapQ9DCD6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GabarapQ9DCD6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GabarapQ9DCD6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GabarapQ9DCD6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GabarapQ9DCD6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GabarapQ9DCD6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GabarapQ9DCD6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GabarapQ9DCD6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GabarapQ9DCD6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GabarapQ9DCD6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GabarapQ9DCD6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GabarapQ9DCD6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GabarapQ9DCD6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GabarapQ9DCD6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GabarapQ9DCD6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GabarapQ9DCD6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GabarapQ9DCD6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GabarapQ9DCD6 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GabarapQ9DCD6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GabarapQ9DCD6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GabarapQ9DCD6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GabarapQ9DCD6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GabarapQ9DCD6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GabarapQ9DCD6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GabarapQ9DCD6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GabarapQ9DCD6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GabarapQ9DCD6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GabarapQ9DCD6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GabarapQ9DCD6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GabarapQ9DCD6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GabarapQ9DCD6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GabarapQ9DCD6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GabarapQ9DCD6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GabarapQ9DCD6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GabarapQ9DCD6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GabarapQ9DCD6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GabarapQ9DCD6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GabarapQ9DCD6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GabarapQ9DCD6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GabarapQ9DCD6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GabarapQ9DCD6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GabarapQ9DCD6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GabarapQ9DCD6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GabarapQ9DCD6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GabarapQ9DCD6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GabarapQ9DCD6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GabarapQ9DCD6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GabarapQ9DCD6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GabarapQ9DCD6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GabarapQ9DCD6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GabarapQ9DCD6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GabarapQ9DCD6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GabarapQ9DCD6 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GabarapQ9DCD6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GabarapQ9DCD6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GabarapQ9DCD6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GabarapQ9DCD6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GabarapQ9DCD6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GabarapQ9DCD6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GabarapQ9DCD6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GabarapQ9DCD6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GabarapQ9DCD6 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GabarapQ9DCD6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GabarapQ9DCD6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GabarapQ9DCD6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GabarapQ9DCD6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GabarapQ9DCD6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GabarapQ9DCD6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GabarapQ9DCD6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GabarapQ9DCD6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GabarapQ9DCD6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GabarapQ9DCD6 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GabarapQ9DCD6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GabarapQ9DCD6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GabarapQ9DCD6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GabarapQ9DCD6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GabarapQ9DCD6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms