Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC53

Cpne8, Copine-8, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne8Q9DC53 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cpne8Q9DC53 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cpne8Q9DC53 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cpne8Q9DC53 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cpne8Q9DC53 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cpne8Q9DC53 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cpne8Q9DC53 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cpne8Q9DC53 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cpne8Q9DC53 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cpne8Q9DC53 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cpne8Q9DC53 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cpne8Q9DC53 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cpne8Q9DC53 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cpne8Q9DC53 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cpne8Q9DC53 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cpne8Q9DC53 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Cpne8Q9DC53 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cpne8Q9DC53 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cpne8Q9DC53 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cpne8Q9DC53 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cpne8Q9DC53 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cpne8Q9DC53 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cpne8Q9DC53 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cpne8Q9DC53 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cpne8Q9DC53 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cpne8Q9DC53 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cpne8Q9DC53 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cpne8Q9DC53 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cpne8Q9DC53 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cpne8Q9DC53 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cpne8Q9DC53 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cpne8Q9DC53 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cpne8Q9DC53 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cpne8Q9DC53 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cpne8Q9DC53 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Cpne8Q9DC53 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Cpne8Q9DC53 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cpne8Q9DC53 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cpne8Q9DC53 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cpne8Q9DC53 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cpne8Q9DC53 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Cpne8Q9DC53 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cpne8Q9DC53 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cpne8Q9DC53 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cpne8Q9DC53 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cpne8Q9DC53 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cpne8Q9DC53 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cpne8Q9DC53 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cpne8Q9DC53 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cpne8Q9DC53 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cpne8Q9DC53 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cpne8Q9DC53 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cpne8Q9DC53 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cpne8Q9DC53 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cpne8Q9DC53 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cpne8Q9DC53 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cpne8Q9DC53 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cpne8Q9DC53 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cpne8Q9DC53 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cpne8Q9DC53 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cpne8Q9DC53 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cpne8Q9DC53 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cpne8Q9DC53 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cpne8Q9DC53 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cpne8Q9DC53 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cpne8Q9DC53 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cpne8Q9DC53 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cpne8Q9DC53 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cpne8Q9DC53 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cpne8Q9DC53 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cpne8Q9DC53 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cpne8Q9DC53 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cpne8Q9DC53 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cpne8Q9DC53 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cpne8Q9DC53 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cpne8Q9DC53 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cpne8Q9DC53 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cpne8Q9DC53 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cpne8Q9DC53 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cpne8Q9DC53 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cpne8Q9DC53 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cpne8Q9DC53 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cpne8Q9DC53 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cpne8Q9DC53 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cpne8Q9DC53 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cpne8Q9DC53 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cpne8Q9DC53 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cpne8Q9DC53 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cpne8Q9DC53 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cpne8Q9DC53 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cpne8Q9DC53 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cpne8Q9DC53 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cpne8Q9DC53 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cpne8Q9DC53 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cpne8Q9DC53 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cpne8Q9DC53 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cpne8Q9DC53 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Cpne8Q9DC53 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cpne8Q9DC53 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cpne8Q9DC53 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms