Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY5

Cbx6, Chromobox protein homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx6Q9DBY5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cbx6Q9DBY5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cbx6Q9DBY5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cbx6Q9DBY5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cbx6Q9DBY5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cbx6Q9DBY5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cbx6Q9DBY5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cbx6Q9DBY5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cbx6Q9DBY5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cbx6Q9DBY5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Cbx6Q9DBY5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cbx6Q9DBY5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cbx6Q9DBY5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cbx6Q9DBY5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cbx6Q9DBY5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cbx6Q9DBY5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cbx6Q9DBY5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cbx6Q9DBY5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cbx6Q9DBY5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cbx6Q9DBY5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cbx6Q9DBY5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cbx6Q9DBY5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cbx6Q9DBY5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cbx6Q9DBY5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cbx6Q9DBY5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cbx6Q9DBY5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Cbx6Q9DBY5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cbx6Q9DBY5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cbx6Q9DBY5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cbx6Q9DBY5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cbx6Q9DBY5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cbx6Q9DBY5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cbx6Q9DBY5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cbx6Q9DBY5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cbx6Q9DBY5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cbx6Q9DBY5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cbx6Q9DBY5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cbx6Q9DBY5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cbx6Q9DBY5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cbx6Q9DBY5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cbx6Q9DBY5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cbx6Q9DBY5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cbx6Q9DBY5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cbx6Q9DBY5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cbx6Q9DBY5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cbx6Q9DBY5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cbx6Q9DBY5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cbx6Q9DBY5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cbx6Q9DBY5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cbx6Q9DBY5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cbx6Q9DBY5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cbx6Q9DBY5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cbx6Q9DBY5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cbx6Q9DBY5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cbx6Q9DBY5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cbx6Q9DBY5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cbx6Q9DBY5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cbx6Q9DBY5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cbx6Q9DBY5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cbx6Q9DBY5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cbx6Q9DBY5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cbx6Q9DBY5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cbx6Q9DBY5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cbx6Q9DBY5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cbx6Q9DBY5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Cbx6Q9DBY5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cbx6Q9DBY5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cbx6Q9DBY5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cbx6Q9DBY5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cbx6Q9DBY5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cbx6Q9DBY5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cbx6Q9DBY5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cbx6Q9DBY5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cbx6Q9DBY5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cbx6Q9DBY5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cbx6Q9DBY5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cbx6Q9DBY5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cbx6Q9DBY5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cbx6Q9DBY5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cbx6Q9DBY5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cbx6Q9DBY5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cbx6Q9DBY5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cbx6Q9DBY5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cbx6Q9DBY5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cbx6Q9DBY5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Cbx6Q9DBY5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cbx6Q9DBY5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cbx6Q9DBY5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cbx6Q9DBY5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cbx6Q9DBY5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cbx6Q9DBY5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cbx6Q9DBY5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cbx6Q9DBY5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cbx6Q9DBY5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cbx6Q9DBY5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cbx6Q9DBY5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cbx6Q9DBY5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cbx6Q9DBY5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cbx6Q9DBY5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cbx6Q9DBY5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.1 ms