Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnf6Q9DBU5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnf6Q9DBU5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnf6Q9DBU5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnf6Q9DBU5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnf6Q9DBU5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rnf6Q9DBU5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rnf6Q9DBU5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rnf6Q9DBU5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rnf6Q9DBU5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rnf6Q9DBU5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rnf6Q9DBU5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Rnf6Q9DBU5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rnf6Q9DBU5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Rnf6Q9DBU5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Rnf6Q9DBU5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rnf6Q9DBU5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rnf6Q9DBU5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rnf6Q9DBU5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rnf6Q9DBU5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rnf6Q9DBU5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rnf6Q9DBU5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rnf6Q9DBU5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rnf6Q9DBU5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rnf6Q9DBU5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rnf6Q9DBU5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rnf6Q9DBU5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rnf6Q9DBU5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rnf6Q9DBU5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rnf6Q9DBU5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rnf6Q9DBU5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rnf6Q9DBU5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rnf6Q9DBU5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rnf6Q9DBU5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rnf6Q9DBU5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rnf6Q9DBU5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rnf6Q9DBU5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rnf6Q9DBU5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rnf6Q9DBU5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rnf6Q9DBU5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnf6Q9DBU5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnf6Q9DBU5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnf6Q9DBU5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnf6Q9DBU5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnf6Q9DBU5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnf6Q9DBU5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnf6Q9DBU5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnf6Q9DBU5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnf6Q9DBU5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnf6Q9DBU5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnf6Q9DBU5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnf6Q9DBU5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnf6Q9DBU5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnf6Q9DBU5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rnf6Q9DBU5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rnf6Q9DBU5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rnf6Q9DBU5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rnf6Q9DBU5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Rnf6Q9DBU5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rnf6Q9DBU5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rnf6Q9DBU5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rnf6Q9DBU5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rnf6Q9DBU5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rnf6Q9DBU5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rnf6Q9DBU5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rnf6Q9DBU5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rnf6Q9DBU5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rnf6Q9DBU5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Rnf6Q9DBU5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rnf6Q9DBU5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rnf6Q9DBU5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rnf6Q9DBU5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rnf6Q9DBU5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rnf6Q9DBU5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rnf6Q9DBU5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rnf6Q9DBU5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rnf6Q9DBU5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rnf6Q9DBU5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rnf6Q9DBU5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rnf6Q9DBU5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rnf6Q9DBU5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rnf6Q9DBU5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rnf6Q9DBU5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rnf6Q9DBU5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rnf6Q9DBU5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rnf6Q9DBU5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rnf6Q9DBU5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rnf6Q9DBU5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rnf6Q9DBU5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rnf6Q9DBU5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rnf6Q9DBU5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rnf6Q9DBU5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rnf6Q9DBU5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rnf6Q9DBU5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rnf6Q9DBU5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rnf6Q9DBU5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rnf6Q9DBU5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rnf6Q9DBU5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Rnf6Q9DBU5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rnf6Q9DBU5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms