Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBS1

Tmem43, Transmembrane protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem43Q9DBS1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem43Q9DBS1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem43Q9DBS1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem43Q9DBS1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem43Q9DBS1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem43Q9DBS1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem43Q9DBS1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem43Q9DBS1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem43Q9DBS1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem43Q9DBS1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem43Q9DBS1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem43Q9DBS1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem43Q9DBS1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem43Q9DBS1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem43Q9DBS1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmem43Q9DBS1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmem43Q9DBS1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmem43Q9DBS1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmem43Q9DBS1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmem43Q9DBS1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmem43Q9DBS1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem43Q9DBS1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem43Q9DBS1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem43Q9DBS1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem43Q9DBS1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem43Q9DBS1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem43Q9DBS1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem43Q9DBS1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem43Q9DBS1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem43Q9DBS1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem43Q9DBS1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem43Q9DBS1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem43Q9DBS1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem43Q9DBS1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem43Q9DBS1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem43Q9DBS1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem43Q9DBS1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem43Q9DBS1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem43Q9DBS1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem43Q9DBS1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem43Q9DBS1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem43Q9DBS1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem43Q9DBS1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem43Q9DBS1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem43Q9DBS1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem43Q9DBS1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem43Q9DBS1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem43Q9DBS1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem43Q9DBS1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem43Q9DBS1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem43Q9DBS1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem43Q9DBS1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem43Q9DBS1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem43Q9DBS1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem43Q9DBS1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem43Q9DBS1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem43Q9DBS1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem43Q9DBS1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem43Q9DBS1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem43Q9DBS1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem43Q9DBS1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem43Q9DBS1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem43Q9DBS1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem43Q9DBS1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem43Q9DBS1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem43Q9DBS1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem43Q9DBS1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem43Q9DBS1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem43Q9DBS1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem43Q9DBS1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem43Q9DBS1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem43Q9DBS1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem43Q9DBS1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem43Q9DBS1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem43Q9DBS1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem43Q9DBS1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem43Q9DBS1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem43Q9DBS1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem43Q9DBS1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem43Q9DBS1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem43Q9DBS1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem43Q9DBS1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem43Q9DBS1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem43Q9DBS1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem43Q9DBS1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem43Q9DBS1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem43Q9DBS1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem43Q9DBS1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem43Q9DBS1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem43Q9DBS1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem43Q9DBS1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem43Q9DBS1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem43Q9DBS1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem43Q9DBS1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem43Q9DBS1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem43Q9DBS1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem43Q9DBS1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem43Q9DBS1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem43Q9DBS1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem43Q9DBS1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms