Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBR1

Xrn2, 5'-3' exoribonuclease 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrn2Q9DBR1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Xrn2Q9DBR1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Xrn2Q9DBR1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Xrn2Q9DBR1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Xrn2Q9DBR1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Xrn2Q9DBR1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Xrn2Q9DBR1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Xrn2Q9DBR1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Xrn2Q9DBR1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Xrn2Q9DBR1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Xrn2Q9DBR1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Xrn2Q9DBR1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Xrn2Q9DBR1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Xrn2Q9DBR1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Xrn2Q9DBR1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Xrn2Q9DBR1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Xrn2Q9DBR1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Xrn2Q9DBR1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Xrn2Q9DBR1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Xrn2Q9DBR1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Xrn2Q9DBR1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Xrn2Q9DBR1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Xrn2Q9DBR1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Xrn2Q9DBR1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Xrn2Q9DBR1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Xrn2Q9DBR1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Xrn2Q9DBR1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Xrn2Q9DBR1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Xrn2Q9DBR1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Xrn2Q9DBR1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Xrn2Q9DBR1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Xrn2Q9DBR1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Xrn2Q9DBR1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Xrn2Q9DBR1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Xrn2Q9DBR1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Xrn2Q9DBR1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Xrn2Q9DBR1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Xrn2Q9DBR1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Xrn2Q9DBR1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Xrn2Q9DBR1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Xrn2Q9DBR1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Xrn2Q9DBR1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Xrn2Q9DBR1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Xrn2Q9DBR1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Xrn2Q9DBR1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Xrn2Q9DBR1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Xrn2Q9DBR1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Xrn2Q9DBR1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Xrn2Q9DBR1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Xrn2Q9DBR1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Xrn2Q9DBR1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Xrn2Q9DBR1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Xrn2Q9DBR1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Xrn2Q9DBR1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Xrn2Q9DBR1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Xrn2Q9DBR1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Xrn2Q9DBR1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Xrn2Q9DBR1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Xrn2Q9DBR1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Xrn2Q9DBR1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Xrn2Q9DBR1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Xrn2Q9DBR1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Xrn2Q9DBR1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Xrn2Q9DBR1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Xrn2Q9DBR1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Xrn2Q9DBR1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Xrn2Q9DBR1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Xrn2Q9DBR1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Xrn2Q9DBR1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Xrn2Q9DBR1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Xrn2Q9DBR1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Xrn2Q9DBR1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Xrn2Q9DBR1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Xrn2Q9DBR1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Xrn2Q9DBR1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Xrn2Q9DBR1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Xrn2Q9DBR1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Xrn2Q9DBR1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Xrn2Q9DBR1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Xrn2Q9DBR1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Xrn2Q9DBR1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Xrn2Q9DBR1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Xrn2Q9DBR1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Xrn2Q9DBR1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Xrn2Q9DBR1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Xrn2Q9DBR1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Xrn2Q9DBR1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Xrn2Q9DBR1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Xrn2Q9DBR1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Xrn2Q9DBR1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Xrn2Q9DBR1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Xrn2Q9DBR1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Xrn2Q9DBR1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Xrn2Q9DBR1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Xrn2Q9DBR1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Xrn2Q9DBR1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Xrn2Q9DBR1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Xrn2Q9DBR1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Xrn2Q9DBR1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Xrn2Q9DBR1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms