Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smg9Q9DB90 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smg9Q9DB90 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smg9Q9DB90 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smg9Q9DB90 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Smg9Q9DB90 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smg9Q9DB90 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smg9Q9DB90 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smg9Q9DB90 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smg9Q9DB90 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Smg9Q9DB90 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Smg9Q9DB90 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smg9Q9DB90 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smg9Q9DB90 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smg9Q9DB90 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smg9Q9DB90 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smg9Q9DB90 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smg9Q9DB90 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smg9Q9DB90 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smg9Q9DB90 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smg9Q9DB90 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smg9Q9DB90 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smg9Q9DB90 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smg9Q9DB90 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smg9Q9DB90 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smg9Q9DB90 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smg9Q9DB90 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smg9Q9DB90 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smg9Q9DB90 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smg9Q9DB90 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Smg9Q9DB90 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smg9Q9DB90 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smg9Q9DB90 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Smg9Q9DB90 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smg9Q9DB90 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smg9Q9DB90 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smg9Q9DB90 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smg9Q9DB90 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Smg9Q9DB90 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smg9Q9DB90 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smg9Q9DB90 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smg9Q9DB90 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smg9Q9DB90 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smg9Q9DB90 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smg9Q9DB90 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smg9Q9DB90 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smg9Q9DB90 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smg9Q9DB90 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smg9Q9DB90 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smg9Q9DB90 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smg9Q9DB90 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smg9Q9DB90 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smg9Q9DB90 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smg9Q9DB90 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smg9Q9DB90 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smg9Q9DB90 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smg9Q9DB90 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smg9Q9DB90 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smg9Q9DB90 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smg9Q9DB90 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smg9Q9DB90 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smg9Q9DB90 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smg9Q9DB90 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smg9Q9DB90 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smg9Q9DB90 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smg9Q9DB90 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smg9Q9DB90 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smg9Q9DB90 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smg9Q9DB90 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smg9Q9DB90 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smg9Q9DB90 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smg9Q9DB90 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smg9Q9DB90 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smg9Q9DB90 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smg9Q9DB90 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Smg9Q9DB90 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smg9Q9DB90 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smg9Q9DB90 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smg9Q9DB90 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smg9Q9DB90 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smg9Q9DB90 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smg9Q9DB90 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smg9Q9DB90 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smg9Q9DB90 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smg9Q9DB90 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smg9Q9DB90 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smg9Q9DB90 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smg9Q9DB90 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smg9Q9DB90 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Smg9Q9DB90 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smg9Q9DB90 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smg9Q9DB90 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smg9Q9DB90 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smg9Q9DB90 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smg9Q9DB90 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Smg9Q9DB90 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smg9Q9DB90 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smg9Q9DB90 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Smg9Q9DB90 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smg9Q9DB90 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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