Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms