Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fundc1Q9DB70 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fundc1Q9DB70 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms