Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smco2Q9DA21 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smco2Q9DA21 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smco2Q9DA21 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smco2Q9DA21 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smco2Q9DA21 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smco2Q9DA21 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smco2Q9DA21 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Smco2Q9DA21 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smco2Q9DA21 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smco2Q9DA21 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smco2Q9DA21 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smco2Q9DA21 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Smco2Q9DA21 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smco2Q9DA21 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smco2Q9DA21 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smco2Q9DA21 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smco2Q9DA21 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smco2Q9DA21 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smco2Q9DA21 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smco2Q9DA21 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smco2Q9DA21 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smco2Q9DA21 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smco2Q9DA21 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smco2Q9DA21 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smco2Q9DA21 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smco2Q9DA21 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Smco2Q9DA21 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Smco2Q9DA21 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smco2Q9DA21 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smco2Q9DA21 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smco2Q9DA21 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smco2Q9DA21 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Smco2Q9DA21 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smco2Q9DA21 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smco2Q9DA21 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smco2Q9DA21 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Smco2Q9DA21 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smco2Q9DA21 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smco2Q9DA21 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smco2Q9DA21 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smco2Q9DA21 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smco2Q9DA21 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smco2Q9DA21 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smco2Q9DA21 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smco2Q9DA21 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smco2Q9DA21 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smco2Q9DA21 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smco2Q9DA21 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smco2Q9DA21 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smco2Q9DA21 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Smco2Q9DA21 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smco2Q9DA21 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smco2Q9DA21 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smco2Q9DA21 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smco2Q9DA21 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smco2Q9DA21 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smco2Q9DA21 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smco2Q9DA21 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smco2Q9DA21 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smco2Q9DA21 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smco2Q9DA21 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smco2Q9DA21 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smco2Q9DA21 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smco2Q9DA21 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smco2Q9DA21 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smco2Q9DA21 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Smco2Q9DA21 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smco2Q9DA21 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smco2Q9DA21 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smco2Q9DA21 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smco2Q9DA21 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Smco2Q9DA21 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Smco2Q9DA21 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smco2Q9DA21 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smco2Q9DA21 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smco2Q9DA21 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smco2Q9DA21 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smco2Q9DA21 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smco2Q9DA21 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smco2Q9DA21 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smco2Q9DA21 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smco2Q9DA21 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smco2Q9DA21 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smco2Q9DA21 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smco2Q9DA21 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smco2Q9DA21 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smco2Q9DA21 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smco2Q9DA21 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smco2Q9DA21 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smco2Q9DA21 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smco2Q9DA21 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smco2Q9DA21 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Smco2Q9DA21 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Smco2Q9DA21 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smco2Q9DA21 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smco2Q9DA21 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smco2Q9DA21 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smco2Q9DA21 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smco2Q9DA21 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 276.9 ms