Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp12Q9D9M2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp12Q9D9M2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp12Q9D9M2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp12Q9D9M2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp12Q9D9M2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp12Q9D9M2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp12Q9D9M2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp12Q9D9M2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp12Q9D9M2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp12Q9D9M2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp12Q9D9M2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp12Q9D9M2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp12Q9D9M2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp12Q9D9M2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp12Q9D9M2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp12Q9D9M2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp12Q9D9M2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp12Q9D9M2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp12Q9D9M2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp12Q9D9M2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp12Q9D9M2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp12Q9D9M2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp12Q9D9M2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp12Q9D9M2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp12Q9D9M2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp12Q9D9M2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp12Q9D9M2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp12Q9D9M2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp12Q9D9M2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp12Q9D9M2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp12Q9D9M2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp12Q9D9M2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp12Q9D9M2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp12Q9D9M2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp12Q9D9M2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp12Q9D9M2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp12Q9D9M2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp12Q9D9M2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp12Q9D9M2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp12Q9D9M2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp12Q9D9M2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp12Q9D9M2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp12Q9D9M2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp12Q9D9M2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp12Q9D9M2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp12Q9D9M2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp12Q9D9M2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp12Q9D9M2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp12Q9D9M2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp12Q9D9M2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp12Q9D9M2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp12Q9D9M2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp12Q9D9M2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp12Q9D9M2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp12Q9D9M2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp12Q9D9M2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp12Q9D9M2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp12Q9D9M2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp12Q9D9M2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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Usp12Q9D9M2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp12Q9D9M2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp12Q9D9M2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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Usp12Q9D9M2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp12Q9D9M2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp12Q9D9M2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp12Q9D9M2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp12Q9D9M2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp12Q9D9M2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp12Q9D9M2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp12Q9D9M2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp12Q9D9M2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp12Q9D9M2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp12Q9D9M2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp12Q9D9M2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp12Q9D9M2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp12Q9D9M2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp12Q9D9M2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp12Q9D9M2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp12Q9D9M2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp12Q9D9M2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp12Q9D9M2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp12Q9D9M2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp12Q9D9M2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp12Q9D9M2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp12Q9D9M2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp12Q9D9M2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp12Q9D9M2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp12Q9D9M2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp12Q9D9M2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp12Q9D9M2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp12Q9D9M2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp12Q9D9M2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp12Q9D9M2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp12Q9D9M2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp12Q9D9M2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp12Q9D9M2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp12Q9D9M2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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