Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9F7

Speer4b, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4bQ9D9F7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Speer4bQ9D9F7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Speer4bQ9D9F7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Speer4bQ9D9F7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Speer4bQ9D9F7 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Speer4bQ9D9F7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Speer4bQ9D9F7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Speer4bQ9D9F7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Speer4bQ9D9F7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Speer4bQ9D9F7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Speer4bQ9D9F7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Speer4bQ9D9F7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Speer4bQ9D9F7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Speer4bQ9D9F7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Speer4bQ9D9F7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Speer4bQ9D9F7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Speer4bQ9D9F7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Speer4bQ9D9F7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Speer4bQ9D9F7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Speer4bQ9D9F7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Speer4bQ9D9F7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Speer4bQ9D9F7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Speer4bQ9D9F7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Speer4bQ9D9F7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Speer4bQ9D9F7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Speer4bQ9D9F7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Speer4bQ9D9F7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Speer4bQ9D9F7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Speer4bQ9D9F7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Speer4bQ9D9F7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Speer4bQ9D9F7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Speer4bQ9D9F7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Speer4bQ9D9F7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Speer4bQ9D9F7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Speer4bQ9D9F7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Speer4bQ9D9F7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Speer4bQ9D9F7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Speer4bQ9D9F7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Speer4bQ9D9F7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Speer4bQ9D9F7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Speer4bQ9D9F7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Speer4bQ9D9F7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Speer4bQ9D9F7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Speer4bQ9D9F7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Speer4bQ9D9F7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Speer4bQ9D9F7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Speer4bQ9D9F7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Speer4bQ9D9F7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Speer4bQ9D9F7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Speer4bQ9D9F7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Speer4bQ9D9F7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Speer4bQ9D9F7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Speer4bQ9D9F7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Speer4bQ9D9F7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Speer4bQ9D9F7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Speer4bQ9D9F7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Speer4bQ9D9F7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Speer4bQ9D9F7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Speer4bQ9D9F7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Speer4bQ9D9F7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Speer4bQ9D9F7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Speer4bQ9D9F7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Speer4bQ9D9F7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Speer4bQ9D9F7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Speer4bQ9D9F7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Speer4bQ9D9F7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Speer4bQ9D9F7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Speer4bQ9D9F7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Speer4bQ9D9F7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Speer4bQ9D9F7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Speer4bQ9D9F7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Speer4bQ9D9F7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Speer4bQ9D9F7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Speer4bQ9D9F7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Speer4bQ9D9F7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Speer4bQ9D9F7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Speer4bQ9D9F7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Speer4bQ9D9F7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Speer4bQ9D9F7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Speer4bQ9D9F7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Speer4bQ9D9F7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Speer4bQ9D9F7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Speer4bQ9D9F7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Speer4bQ9D9F7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Speer4bQ9D9F7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Speer4bQ9D9F7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Speer4bQ9D9F7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Speer4bQ9D9F7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Speer4bQ9D9F7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Speer4bQ9D9F7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Speer4bQ9D9F7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Speer4bQ9D9F7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Speer4bQ9D9F7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Speer4bQ9D9F7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Speer4bQ9D9F7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Speer4bQ9D9F7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Speer4bQ9D9F7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Speer4bQ9D9F7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Speer4bQ9D9F7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Speer4bQ9D9F7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms