Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atg7Q9D906 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atg7Q9D906 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Atg7Q9D906 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Atg7Q9D906 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atg7Q9D906 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atg7Q9D906 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atg7Q9D906 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atg7Q9D906 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atg7Q9D906 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atg7Q9D906 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atg7Q9D906 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atg7Q9D906 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atg7Q9D906 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atg7Q9D906 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atg7Q9D906 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Atg7Q9D906 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Atg7Q9D906 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Atg7Q9D906 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atg7Q9D906 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atg7Q9D906 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atg7Q9D906 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atg7Q9D906 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atg7Q9D906 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atg7Q9D906 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atg7Q9D906 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atg7Q9D906 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Atg7Q9D906 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atg7Q9D906 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atg7Q9D906 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atg7Q9D906 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atg7Q9D906 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atg7Q9D906 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atg7Q9D906 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atg7Q9D906 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atg7Q9D906 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atg7Q9D906 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atg7Q9D906 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atg7Q9D906 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Atg7Q9D906 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atg7Q9D906 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atg7Q9D906 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atg7Q9D906 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atg7Q9D906 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atg7Q9D906 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atg7Q9D906 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atg7Q9D906 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atg7Q9D906 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atg7Q9D906 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atg7Q9D906 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atg7Q9D906 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atg7Q9D906 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atg7Q9D906 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atg7Q9D906 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atg7Q9D906 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atg7Q9D906 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atg7Q9D906 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atg7Q9D906 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atg7Q9D906 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atg7Q9D906 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atg7Q9D906 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Atg7Q9D906 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atg7Q9D906 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atg7Q9D906 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atg7Q9D906 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atg7Q9D906 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atg7Q9D906 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atg7Q9D906 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atg7Q9D906 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atg7Q9D906 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atg7Q9D906 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atg7Q9D906 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atg7Q9D906 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atg7Q9D906 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atg7Q9D906 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atg7Q9D906 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atg7Q9D906 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atg7Q9D906 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atg7Q9D906 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atg7Q9D906 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atg7Q9D906 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atg7Q9D906 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atg7Q9D906 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atg7Q9D906 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atg7Q9D906 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atg7Q9D906 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Atg7Q9D906 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atg7Q9D906 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atg7Q9D906 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atg7Q9D906 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atg7Q9D906 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atg7Q9D906 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atg7Q9D906 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atg7Q9D906 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atg7Q9D906 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atg7Q9D906 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atg7Q9D906 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atg7Q9D906 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atg7Q9D906 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atg7Q9D906 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms