Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tvp23bQ9D8T4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tvp23bQ9D8T4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tvp23bQ9D8T4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tvp23bQ9D8T4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tvp23bQ9D8T4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tvp23bQ9D8T4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tvp23bQ9D8T4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tvp23bQ9D8T4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tvp23bQ9D8T4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tvp23bQ9D8T4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tvp23bQ9D8T4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tvp23bQ9D8T4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tvp23bQ9D8T4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tvp23bQ9D8T4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tvp23bQ9D8T4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tvp23bQ9D8T4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tvp23bQ9D8T4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tvp23bQ9D8T4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tvp23bQ9D8T4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Tvp23bQ9D8T4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tvp23bQ9D8T4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tvp23bQ9D8T4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tvp23bQ9D8T4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tvp23bQ9D8T4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tvp23bQ9D8T4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tvp23bQ9D8T4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tvp23bQ9D8T4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tvp23bQ9D8T4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tvp23bQ9D8T4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tvp23bQ9D8T4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tvp23bQ9D8T4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tvp23bQ9D8T4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tvp23bQ9D8T4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tvp23bQ9D8T4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tvp23bQ9D8T4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tvp23bQ9D8T4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tvp23bQ9D8T4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tvp23bQ9D8T4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tvp23bQ9D8T4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tvp23bQ9D8T4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tvp23bQ9D8T4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tvp23bQ9D8T4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tvp23bQ9D8T4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tvp23bQ9D8T4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tvp23bQ9D8T4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tvp23bQ9D8T4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tvp23bQ9D8T4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tvp23bQ9D8T4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tvp23bQ9D8T4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tvp23bQ9D8T4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tvp23bQ9D8T4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tvp23bQ9D8T4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tvp23bQ9D8T4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tvp23bQ9D8T4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tvp23bQ9D8T4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tvp23bQ9D8T4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tvp23bQ9D8T4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tvp23bQ9D8T4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tvp23bQ9D8T4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tvp23bQ9D8T4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tvp23bQ9D8T4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tvp23bQ9D8T4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tvp23bQ9D8T4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tvp23bQ9D8T4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tvp23bQ9D8T4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tvp23bQ9D8T4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tvp23bQ9D8T4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tvp23bQ9D8T4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tvp23bQ9D8T4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tvp23bQ9D8T4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tvp23bQ9D8T4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tvp23bQ9D8T4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tvp23bQ9D8T4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tvp23bQ9D8T4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tvp23bQ9D8T4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tvp23bQ9D8T4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tvp23bQ9D8T4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tvp23bQ9D8T4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tvp23bQ9D8T4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tvp23bQ9D8T4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tvp23bQ9D8T4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tvp23bQ9D8T4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tvp23bQ9D8T4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tvp23bQ9D8T4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tvp23bQ9D8T4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tvp23bQ9D8T4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tvp23bQ9D8T4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tvp23bQ9D8T4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tvp23bQ9D8T4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tvp23bQ9D8T4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tvp23bQ9D8T4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tvp23bQ9D8T4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tvp23bQ9D8T4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tvp23bQ9D8T4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tvp23bQ9D8T4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tvp23bQ9D8T4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tvp23bQ9D8T4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tvp23bQ9D8T4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tvp23bQ9D8T4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms