Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms