Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C3

Alg13, Putative bifunctional UDP-N-acetylglucosamine transferase and deubiquitinase ALG13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alg13Q9D8C3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Alg13Q9D8C3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Alg13Q9D8C3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Alg13Q9D8C3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Alg13Q9D8C3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Alg13Q9D8C3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Alg13Q9D8C3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Alg13Q9D8C3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Alg13Q9D8C3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Alg13Q9D8C3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Alg13Q9D8C3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Alg13Q9D8C3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Alg13Q9D8C3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Alg13Q9D8C3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Alg13Q9D8C3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Alg13Q9D8C3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Alg13Q9D8C3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Alg13Q9D8C3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Alg13Q9D8C3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Alg13Q9D8C3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Alg13Q9D8C3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Alg13Q9D8C3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Alg13Q9D8C3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Alg13Q9D8C3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Alg13Q9D8C3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Alg13Q9D8C3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Alg13Q9D8C3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Alg13Q9D8C3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Alg13Q9D8C3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Alg13Q9D8C3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Alg13Q9D8C3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Alg13Q9D8C3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Alg13Q9D8C3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Alg13Q9D8C3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Alg13Q9D8C3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Alg13Q9D8C3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Alg13Q9D8C3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Alg13Q9D8C3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Alg13Q9D8C3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Alg13Q9D8C3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Alg13Q9D8C3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Alg13Q9D8C3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Alg13Q9D8C3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Alg13Q9D8C3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Alg13Q9D8C3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Alg13Q9D8C3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Alg13Q9D8C3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Alg13Q9D8C3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Alg13Q9D8C3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Alg13Q9D8C3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Alg13Q9D8C3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Alg13Q9D8C3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Alg13Q9D8C3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Alg13Q9D8C3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Alg13Q9D8C3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Alg13Q9D8C3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Alg13Q9D8C3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Alg13Q9D8C3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Alg13Q9D8C3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Alg13Q9D8C3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Alg13Q9D8C3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Alg13Q9D8C3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Alg13Q9D8C3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Alg13Q9D8C3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Alg13Q9D8C3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Alg13Q9D8C3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Alg13Q9D8C3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Alg13Q9D8C3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Alg13Q9D8C3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Alg13Q9D8C3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Alg13Q9D8C3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Alg13Q9D8C3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Alg13Q9D8C3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Alg13Q9D8C3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Alg13Q9D8C3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Alg13Q9D8C3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Alg13Q9D8C3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Alg13Q9D8C3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Alg13Q9D8C3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Alg13Q9D8C3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Alg13Q9D8C3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Alg13Q9D8C3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Alg13Q9D8C3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Alg13Q9D8C3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Alg13Q9D8C3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Alg13Q9D8C3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Alg13Q9D8C3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Alg13Q9D8C3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Alg13Q9D8C3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Alg13Q9D8C3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Alg13Q9D8C3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Alg13Q9D8C3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Alg13Q9D8C3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Alg13Q9D8C3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Alg13Q9D8C3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Alg13Q9D8C3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Alg13Q9D8C3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Alg13Q9D8C3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Alg13Q9D8C3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Alg13Q9D8C3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms