Protein–RNA interactions for Protein: Q9D883

U2af1, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1Q9D883 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
U2af1Q9D883 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
U2af1Q9D883 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
U2af1Q9D883 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
U2af1Q9D883 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
U2af1Q9D883 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
U2af1Q9D883 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
U2af1Q9D883 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
U2af1Q9D883 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
U2af1Q9D883 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
U2af1Q9D883 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
U2af1Q9D883 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
U2af1Q9D883 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
U2af1Q9D883 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
U2af1Q9D883 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
U2af1Q9D883 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
U2af1Q9D883 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
U2af1Q9D883 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
U2af1Q9D883 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
U2af1Q9D883 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
U2af1Q9D883 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
U2af1Q9D883 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
U2af1Q9D883 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
U2af1Q9D883 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
U2af1Q9D883 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
U2af1Q9D883 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
U2af1Q9D883 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
U2af1Q9D883 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
U2af1Q9D883 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
U2af1Q9D883 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
U2af1Q9D883 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
U2af1Q9D883 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
U2af1Q9D883 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
U2af1Q9D883 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
U2af1Q9D883 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
U2af1Q9D883 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
U2af1Q9D883 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
U2af1Q9D883 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
U2af1Q9D883 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
U2af1Q9D883 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
U2af1Q9D883 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
U2af1Q9D883 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
U2af1Q9D883 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
U2af1Q9D883 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
U2af1Q9D883 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
U2af1Q9D883 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
U2af1Q9D883 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
U2af1Q9D883 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
U2af1Q9D883 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
U2af1Q9D883 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
U2af1Q9D883 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
U2af1Q9D883 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
U2af1Q9D883 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
U2af1Q9D883 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
U2af1Q9D883 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
U2af1Q9D883 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
U2af1Q9D883 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
U2af1Q9D883 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
U2af1Q9D883 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
U2af1Q9D883 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
U2af1Q9D883 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
U2af1Q9D883 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
U2af1Q9D883 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
U2af1Q9D883 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
U2af1Q9D883 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
U2af1Q9D883 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
U2af1Q9D883 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
U2af1Q9D883 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
U2af1Q9D883 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
U2af1Q9D883 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
U2af1Q9D883 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
U2af1Q9D883 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
U2af1Q9D883 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
U2af1Q9D883 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
U2af1Q9D883 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
U2af1Q9D883 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
U2af1Q9D883 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
U2af1Q9D883 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
U2af1Q9D883 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
U2af1Q9D883 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
U2af1Q9D883 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
U2af1Q9D883 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
U2af1Q9D883 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
U2af1Q9D883 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
U2af1Q9D883 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
U2af1Q9D883 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
U2af1Q9D883 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
U2af1Q9D883 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
U2af1Q9D883 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
U2af1Q9D883 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
U2af1Q9D883 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
U2af1Q9D883 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
U2af1Q9D883 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
U2af1Q9D883 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
U2af1Q9D883 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
U2af1Q9D883 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
U2af1Q9D883 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
U2af1Q9D883 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
U2af1Q9D883 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
U2af1Q9D883 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms